Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hist2h2abQ64522 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hist2h2abQ64522 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hist2h2abQ64522 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hist2h2abQ64522 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hist2h2abQ64522 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hist2h2abQ64522 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hist2h2abQ64522 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hist2h2abQ64522 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hist2h2abQ64522 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hist2h2abQ64522 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2abQ64522 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hist2h2abQ64522 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hist2h2abQ64522 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hist2h2abQ64522 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hist2h2abQ64522 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hist2h2abQ64522 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hist2h2abQ64522 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hist2h2abQ64522 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hist2h2abQ64522 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2abQ64522 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hist2h2abQ64522 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2abQ64522 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hist2h2abQ64522 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hist2h2abQ64522 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2abQ64522 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2abQ64522 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist2h2abQ64522 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2abQ64522 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2abQ64522 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2abQ64522 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2abQ64522 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hist2h2abQ64522 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hist2h2abQ64522 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hist2h2abQ64522 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hist2h2abQ64522 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms