Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Phc1Q64028 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Phc1Q64028 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Phc1Q64028 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Phc1Q64028 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Phc1Q64028 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Phc1Q64028 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Phc1Q64028 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Phc1Q64028 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Phc1Q64028 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Phc1Q64028 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Phc1Q64028 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Phc1Q64028 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Phc1Q64028 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Phc1Q64028 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Phc1Q64028 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Phc1Q64028 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Phc1Q64028 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Phc1Q64028 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Phc1Q64028 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Phc1Q64028 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Phc1Q64028 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Phc1Q64028 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Phc1Q64028 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Phc1Q64028 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phc1Q64028 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Phc1Q64028 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Phc1Q64028 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phc1Q64028 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phc1Q64028 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Phc1Q64028 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Phc1Q64028 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Phc1Q64028 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phc1Q64028 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phc1Q64028 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Phc1Q64028 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Phc1Q64028 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phc1Q64028 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms