Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab34Q64008 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab34Q64008 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab34Q64008 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab34Q64008 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab34Q64008 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab34Q64008 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab34Q64008 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab34Q64008 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab34Q64008 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rab34Q64008 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab34Q64008 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab34Q64008 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab34Q64008 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab34Q64008 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rab34Q64008 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab34Q64008 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab34Q64008 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab34Q64008 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab34Q64008 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab34Q64008 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab34Q64008 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab34Q64008 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab34Q64008 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab34Q64008 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab34Q64008 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab34Q64008 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab34Q64008 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab34Q64008 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab34Q64008 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab34Q64008 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab34Q64008 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab34Q64008 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab34Q64008 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab34Q64008 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab34Q64008 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab34Q64008 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab34Q64008 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab34Q64008 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rab34Q64008 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab34Q64008 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab34Q64008 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab34Q64008 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab34Q64008 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab34Q64008 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab34Q64008 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab34Q64008 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab34Q64008 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab34Q64008 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab34Q64008 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab34Q64008 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab34Q64008 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab34Q64008 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms