Protein–RNA interactions for Protein: Q61851

Fgfr3, Fibroblast growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr3Q61851 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fgfr3Q61851 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgfr3Q61851 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fgfr3Q61851 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fgfr3Q61851 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fgfr3Q61851 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fgfr3Q61851 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fgfr3Q61851 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgfr3Q61851 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fgfr3Q61851 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgfr3Q61851 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgfr3Q61851 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fgfr3Q61851 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgfr3Q61851 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fgfr3Q61851 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fgfr3Q61851 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fgfr3Q61851 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fgfr3Q61851 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Fgfr3Q61851 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fgfr3Q61851 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fgfr3Q61851 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fgfr3Q61851 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fgfr3Q61851 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fgfr3Q61851 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgfr3Q61851 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr3Q61851 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgfr3Q61851 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgfr3Q61851 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr3Q61851 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgfr3Q61851 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgfr3Q61851 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgfr3Q61851 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgfr3Q61851 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgfr3Q61851 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgfr3Q61851 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgfr3Q61851 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgfr3Q61851 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr3Q61851 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgfr3Q61851 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgfr3Q61851 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fgfr3Q61851 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fgfr3Q61851 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms