Protein–RNA interactions for Protein: Q61548

Snap91, Clathrin coat assembly protein AP180, mousemouse

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap91Q61548 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Snap91Q61548 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snap91Q61548 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snap91Q61548 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snap91Q61548 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snap91Q61548 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snap91Q61548 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap91Q61548 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snap91Q61548 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap91Q61548 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snap91Q61548 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap91Q61548 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap91Q61548 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snap91Q61548 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap91Q61548 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap91Q61548 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap91Q61548 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap91Q61548 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snap91Q61548 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snap91Q61548 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snap91Q61548 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap91Q61548 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap91Q61548 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap91Q61548 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snap91Q61548 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snap91Q61548 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snap91Q61548 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snap91Q61548 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snap91Q61548 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snap91Q61548 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snap91Q61548 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 395.3 ms