Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpc6Q61143 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpc6Q61143 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpc6Q61143 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpc6Q61143 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpc6Q61143 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpc6Q61143 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpc6Q61143 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpc6Q61143 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpc6Q61143 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trpc6Q61143 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpc6Q61143 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpc6Q61143 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpc6Q61143 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpc6Q61143 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpc6Q61143 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpc6Q61143 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trpc6Q61143 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpc6Q61143 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpc6Q61143 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpc6Q61143 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpc6Q61143 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trpc6Q61143 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpc6Q61143 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Trpc6Q61143 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpc6Q61143 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpc6Q61143 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpc6Q61143 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpc6Q61143 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpc6Q61143 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpc6Q61143 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trpc6Q61143 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpc6Q61143 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpc6Q61143 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpc6Q61143 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpc6Q61143 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpc6Q61143 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpc6Q61143 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpc6Q61143 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpc6Q61143 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpc6Q61143 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpc6Q61143 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trpc6Q61143 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trpc6Q61143 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trpc6Q61143 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trpc6Q61143 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpc6Q61143 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trpc6Q61143 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpc6Q61143 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trpc6Q61143 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trpc6Q61143 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpc6Q61143 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpc6Q61143 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpc6Q61143 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Trpc6Q61143 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpc6Q61143 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms