Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prpf4bQ61136 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prpf4bQ61136 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prpf4bQ61136 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prpf4bQ61136 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prpf4bQ61136 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prpf4bQ61136 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prpf4bQ61136 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prpf4bQ61136 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prpf4bQ61136 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prpf4bQ61136 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prpf4bQ61136 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prpf4bQ61136 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prpf4bQ61136 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prpf4bQ61136 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prpf4bQ61136 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Prpf4bQ61136 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prpf4bQ61136 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prpf4bQ61136 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Prpf4bQ61136 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prpf4bQ61136 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prpf4bQ61136 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prpf4bQ61136 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prpf4bQ61136 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prpf4bQ61136 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prpf4bQ61136 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prpf4bQ61136 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Prpf4bQ61136 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prpf4bQ61136 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Prpf4bQ61136 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prpf4bQ61136 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prpf4bQ61136 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prpf4bQ61136 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prpf4bQ61136 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prpf4bQ61136 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prpf4bQ61136 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prpf4bQ61136 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prpf4bQ61136 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prpf4bQ61136 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prpf4bQ61136 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Prpf4bQ61136 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prpf4bQ61136 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prpf4bQ61136 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prpf4bQ61136 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prpf4bQ61136 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prpf4bQ61136 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prpf4bQ61136 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prpf4bQ61136 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prpf4bQ61136 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prpf4bQ61136 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prpf4bQ61136 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prpf4bQ61136 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Prpf4bQ61136 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prpf4bQ61136 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Prpf4bQ61136 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prpf4bQ61136 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prpf4bQ61136 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prpf4bQ61136 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prpf4bQ61136 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prpf4bQ61136 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prpf4bQ61136 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prpf4bQ61136 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prpf4bQ61136 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prpf4bQ61136 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prpf4bQ61136 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Prpf4bQ61136 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms