Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
P4ha1Q60715 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
P4ha1Q60715 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
P4ha1Q60715 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
P4ha1Q60715 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
P4ha1Q60715 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
P4ha1Q60715 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
P4ha1Q60715 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
P4ha1Q60715 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
P4ha1Q60715 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
P4ha1Q60715 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P4ha1Q60715 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
P4ha1Q60715 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
P4ha1Q60715 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
P4ha1Q60715 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
P4ha1Q60715 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
P4ha1Q60715 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
P4ha1Q60715 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
P4ha1Q60715 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
P4ha1Q60715 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
P4ha1Q60715 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
P4ha1Q60715 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
P4ha1Q60715 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
P4ha1Q60715 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
P4ha1Q60715 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P4ha1Q60715 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
P4ha1Q60715 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
P4ha1Q60715 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
P4ha1Q60715 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
P4ha1Q60715 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
P4ha1Q60715 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
P4ha1Q60715 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
P4ha1Q60715 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
P4ha1Q60715 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
P4ha1Q60715 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
P4ha1Q60715 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
P4ha1Q60715 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
P4ha1Q60715 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
P4ha1Q60715 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
P4ha1Q60715 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
P4ha1Q60715 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
P4ha1Q60715 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
P4ha1Q60715 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
P4ha1Q60715 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
P4ha1Q60715 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
P4ha1Q60715 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms