Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thoc6Q5U4D9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Thoc6Q5U4D9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Thoc6Q5U4D9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thoc6Q5U4D9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Thoc6Q5U4D9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Thoc6Q5U4D9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thoc6Q5U4D9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Thoc6Q5U4D9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thoc6Q5U4D9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc6Q5U4D9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thoc6Q5U4D9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Thoc6Q5U4D9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Thoc6Q5U4D9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Thoc6Q5U4D9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Thoc6Q5U4D9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Thoc6Q5U4D9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Thoc6Q5U4D9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thoc6Q5U4D9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Thoc6Q5U4D9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Thoc6Q5U4D9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Thoc6Q5U4D9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Thoc6Q5U4D9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Thoc6Q5U4D9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Thoc6Q5U4D9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Thoc6Q5U4D9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Thoc6Q5U4D9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Thoc6Q5U4D9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Thoc6Q5U4D9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thoc6Q5U4D9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thoc6Q5U4D9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thoc6Q5U4D9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Thoc6Q5U4D9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thoc6Q5U4D9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Thoc6Q5U4D9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms