Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps41Q5KU39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps41Q5KU39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps41Q5KU39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps41Q5KU39 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps41Q5KU39 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps41Q5KU39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps41Q5KU39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps41Q5KU39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps41Q5KU39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps41Q5KU39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps41Q5KU39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps41Q5KU39 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps41Q5KU39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps41Q5KU39 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps41Q5KU39 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps41Q5KU39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps41Q5KU39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps41Q5KU39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps41Q5KU39 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps41Q5KU39 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps41Q5KU39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps41Q5KU39 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps41Q5KU39 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps41Q5KU39 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps41Q5KU39 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps41Q5KU39 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps41Q5KU39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps41Q5KU39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps41Q5KU39 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps41Q5KU39 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps41Q5KU39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps41Q5KU39 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps41Q5KU39 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps41Q5KU39 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms