Protein–RNA interactions for Protein: Q58Y74

Trcg1, Taste receptor cell protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trcg1Q58Y74 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trcg1Q58Y74 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trcg1Q58Y74 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trcg1Q58Y74 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Trcg1Q58Y74 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trcg1Q58Y74 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trcg1Q58Y74 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trcg1Q58Y74 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trcg1Q58Y74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trcg1Q58Y74 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trcg1Q58Y74 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trcg1Q58Y74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trcg1Q58Y74 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trcg1Q58Y74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trcg1Q58Y74 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trcg1Q58Y74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trcg1Q58Y74 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trcg1Q58Y74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trcg1Q58Y74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trcg1Q58Y74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trcg1Q58Y74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trcg1Q58Y74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trcg1Q58Y74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trcg1Q58Y74 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trcg1Q58Y74 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trcg1Q58Y74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trcg1Q58Y74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trcg1Q58Y74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trcg1Q58Y74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trcg1Q58Y74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trcg1Q58Y74 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trcg1Q58Y74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trcg1Q58Y74 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trcg1Q58Y74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trcg1Q58Y74 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trcg1Q58Y74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trcg1Q58Y74 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms