Protein–RNA interactions for Protein: Q505G8

Znf827, Zinc finger protein 827, mousemouse

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf827Q505G8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Znf827Q505G8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Znf827Q505G8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Znf827Q505G8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Znf827Q505G8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Znf827Q505G8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Znf827Q505G8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Znf827Q505G8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Znf827Q505G8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Znf827Q505G8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Znf827Q505G8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Znf827Q505G8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Znf827Q505G8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Znf827Q505G8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Znf827Q505G8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Znf827Q505G8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Znf827Q505G8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Znf827Q505G8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Znf827Q505G8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Znf827Q505G8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Znf827Q505G8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Znf827Q505G8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Znf827Q505G8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Znf827Q505G8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Znf827Q505G8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Znf827Q505G8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Znf827Q505G8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Znf827Q505G8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Znf827Q505G8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Znf827Q505G8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Znf827Q505G8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Znf827Q505G8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Znf827Q505G8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Znf827Q505G8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Znf827Q505G8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Znf827Q505G8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Znf827Q505G8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Znf827Q505G8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Znf827Q505G8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Znf827Q505G8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Znf827Q505G8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Znf827Q505G8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Znf827Q505G8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Znf827Q505G8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Znf827Q505G8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Znf827Q505G8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Znf827Q505G8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Znf827Q505G8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Znf827Q505G8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Znf827Q505G8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,6 ms