Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Syne3Q4FZC9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syne3Q4FZC9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syne3Q4FZC9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syne3Q4FZC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syne3Q4FZC9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Syne3Q4FZC9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Syne3Q4FZC9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Syne3Q4FZC9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syne3Q4FZC9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syne3Q4FZC9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syne3Q4FZC9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Syne3Q4FZC9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syne3Q4FZC9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syne3Q4FZC9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syne3Q4FZC9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syne3Q4FZC9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syne3Q4FZC9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syne3Q4FZC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Syne3Q4FZC9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syne3Q4FZC9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Syne3Q4FZC9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syne3Q4FZC9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Syne3Q4FZC9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syne3Q4FZC9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syne3Q4FZC9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syne3Q4FZC9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syne3Q4FZC9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syne3Q4FZC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syne3Q4FZC9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syne3Q4FZC9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syne3Q4FZC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syne3Q4FZC9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Syne3Q4FZC9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syne3Q4FZC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syne3Q4FZC9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syne3Q4FZC9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syne3Q4FZC9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syne3Q4FZC9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Syne3Q4FZC9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syne3Q4FZC9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syne3Q4FZC9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Syne3Q4FZC9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Syne3Q4FZC9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Syne3Q4FZC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Syne3Q4FZC9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms