Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
6430531B16RikQ3V2J1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
6430531B16RikQ3V2J1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
6430531B16RikQ3V2J1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
6430531B16RikQ3V2J1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
6430531B16RikQ3V2J1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
6430531B16RikQ3V2J1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
6430531B16RikQ3V2J1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
6430531B16RikQ3V2J1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6430531B16RikQ3V2J1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
6430531B16RikQ3V2J1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
6430531B16RikQ3V2J1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
6430531B16RikQ3V2J1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6430531B16RikQ3V2J1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
6430531B16RikQ3V2J1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
6430531B16RikQ3V2J1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
6430531B16RikQ3V2J1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms