Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1U8

Elmod1, ELMO domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elmod1Q3V1U8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elmod1Q3V1U8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elmod1Q3V1U8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elmod1Q3V1U8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elmod1Q3V1U8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Elmod1Q3V1U8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Elmod1Q3V1U8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Elmod1Q3V1U8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Elmod1Q3V1U8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elmod1Q3V1U8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elmod1Q3V1U8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elmod1Q3V1U8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elmod1Q3V1U8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elmod1Q3V1U8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elmod1Q3V1U8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Elmod1Q3V1U8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Elmod1Q3V1U8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms