Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
C87499Q3UX49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
C87499Q3UX49 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C87499Q3UX49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C87499Q3UX49 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C87499Q3UX49 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C87499Q3UX49 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C87499Q3UX49 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C87499Q3UX49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
C87499Q3UX49 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C87499Q3UX49 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C87499Q3UX49 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C87499Q3UX49 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C87499Q3UX49 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C87499Q3UX49 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C87499Q3UX49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
C87499Q3UX49 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C87499Q3UX49 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C87499Q3UX49 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C87499Q3UX49 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C87499Q3UX49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C87499Q3UX49 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C87499Q3UX49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C87499Q3UX49 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C87499Q3UX49 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
C87499Q3UX49 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C87499Q3UX49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C87499Q3UX49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C87499Q3UX49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
C87499Q3UX49 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C87499Q3UX49 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C87499Q3UX49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C87499Q3UX49 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C87499Q3UX49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C87499Q3UX49 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C87499Q3UX49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C87499Q3UX49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C87499Q3UX49 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C87499Q3UX49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C87499Q3UX49 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C87499Q3UX49 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C87499Q3UX49 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C87499Q3UX49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C87499Q3UX49 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C87499Q3UX49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C87499Q3UX49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C87499Q3UX49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C87499Q3UX49 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C87499Q3UX49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms