Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pfdn4Q3UWL8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pfdn4Q3UWL8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pfdn4Q3UWL8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pfdn4Q3UWL8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pfdn4Q3UWL8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pfdn4Q3UWL8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pfdn4Q3UWL8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pfdn4Q3UWL8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pfdn4Q3UWL8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pfdn4Q3UWL8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pfdn4Q3UWL8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pfdn4Q3UWL8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pfdn4Q3UWL8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pfdn4Q3UWL8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pfdn4Q3UWL8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pfdn4Q3UWL8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pfdn4Q3UWL8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pfdn4Q3UWL8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pfdn4Q3UWL8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pfdn4Q3UWL8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pfdn4Q3UWL8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pfdn4Q3UWL8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pfdn4Q3UWL8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pfdn4Q3UWL8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pfdn4Q3UWL8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pfdn4Q3UWL8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pfdn4Q3UWL8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pfdn4Q3UWL8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pfdn4Q3UWL8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms