Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE9

Lingo2, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo2Q3URE9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lingo2Q3URE9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lingo2Q3URE9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lingo2Q3URE9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lingo2Q3URE9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lingo2Q3URE9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lingo2Q3URE9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lingo2Q3URE9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lingo2Q3URE9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lingo2Q3URE9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lingo2Q3URE9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lingo2Q3URE9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lingo2Q3URE9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lingo2Q3URE9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lingo2Q3URE9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lingo2Q3URE9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lingo2Q3URE9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lingo2Q3URE9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lingo2Q3URE9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lingo2Q3URE9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lingo2Q3URE9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lingo2Q3URE9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lingo2Q3URE9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lingo2Q3URE9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lingo2Q3URE9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo2Q3URE9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lingo2Q3URE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lingo2Q3URE9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms