Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMM4

Cdk10, Cyclin-dependent kinase 10, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk10Q3UMM4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk10Q3UMM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk10Q3UMM4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk10Q3UMM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk10Q3UMM4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk10Q3UMM4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk10Q3UMM4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk10Q3UMM4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk10Q3UMM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk10Q3UMM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk10Q3UMM4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk10Q3UMM4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk10Q3UMM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdk10Q3UMM4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk10Q3UMM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk10Q3UMM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk10Q3UMM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk10Q3UMM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk10Q3UMM4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk10Q3UMM4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk10Q3UMM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk10Q3UMM4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk10Q3UMM4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk10Q3UMM4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk10Q3UMM4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk10Q3UMM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk10Q3UMM4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk10Q3UMM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk10Q3UMM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk10Q3UMM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk10Q3UMM4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk10Q3UMM4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk10Q3UMM4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk10Q3UMM4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk10Q3UMM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk10Q3UMM4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk10Q3UMM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk10Q3UMM4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk10Q3UMM4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk10Q3UMM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk10Q3UMM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk10Q3UMM4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk10Q3UMM4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk10Q3UMM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk10Q3UMM4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk10Q3UMM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk10Q3UMM4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms