Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc58Q3UGP9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc58Q3UGP9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc58Q3UGP9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc58Q3UGP9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc58Q3UGP9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc58Q3UGP9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc58Q3UGP9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc58Q3UGP9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc58Q3UGP9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc58Q3UGP9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc58Q3UGP9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc58Q3UGP9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc58Q3UGP9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc58Q3UGP9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc58Q3UGP9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc58Q3UGP9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc58Q3UGP9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc58Q3UGP9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc58Q3UGP9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc58Q3UGP9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc58Q3UGP9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc58Q3UGP9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc58Q3UGP9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc58Q3UGP9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc58Q3UGP9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc58Q3UGP9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc58Q3UGP9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc58Q3UGP9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc58Q3UGP9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc58Q3UGP9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc58Q3UGP9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc58Q3UGP9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc58Q3UGP9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc58Q3UGP9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc58Q3UGP9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc58Q3UGP9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc58Q3UGP9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc58Q3UGP9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc58Q3UGP9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc58Q3UGP9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc58Q3UGP9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc58Q3UGP9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc58Q3UGP9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc58Q3UGP9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc58Q3UGP9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc58Q3UGP9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms