Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mmp25Q3U435 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mmp25Q3U435 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp25Q3U435 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mmp25Q3U435 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp25Q3U435 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp25Q3U435 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mmp25Q3U435 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp25Q3U435 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mmp25Q3U435 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp25Q3U435 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp25Q3U435 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp25Q3U435 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp25Q3U435 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mmp25Q3U435 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp25Q3U435 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp25Q3U435 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp25Q3U435 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp25Q3U435 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mmp25Q3U435 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp25Q3U435 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp25Q3U435 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mmp25Q3U435 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp25Q3U435 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp25Q3U435 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp25Q3U435 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp25Q3U435 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp25Q3U435 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp25Q3U435 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp25Q3U435 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp25Q3U435 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp25Q3U435 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp25Q3U435 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp25Q3U435 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp25Q3U435 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp25Q3U435 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp25Q3U435 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp25Q3U435 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp25Q3U435 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp25Q3U435 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp25Q3U435 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp25Q3U435 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms