Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Ulk3Q3U3Q1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Ulk3Q3U3Q1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ulk3Q3U3Q1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ulk3Q3U3Q1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ulk3Q3U3Q1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ulk3Q3U3Q1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ulk3Q3U3Q1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ulk3Q3U3Q1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ulk3Q3U3Q1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Ulk3Q3U3Q1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ulk3Q3U3Q1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ulk3Q3U3Q1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ulk3Q3U3Q1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ulk3Q3U3Q1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Ulk3Q3U3Q1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ulk3Q3U3Q1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Ulk3Q3U3Q1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Ulk3Q3U3Q1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Ulk3Q3U3Q1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ulk3Q3U3Q1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ulk3Q3U3Q1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ulk3Q3U3Q1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ulk3Q3U3Q1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ulk3Q3U3Q1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Ulk3Q3U3Q1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ulk3Q3U3Q1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ulk3Q3U3Q1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ulk3Q3U3Q1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Ulk3Q3U3Q1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ulk3Q3U3Q1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ulk3Q3U3Q1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Ulk3Q3U3Q1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Ulk3Q3U3Q1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Ulk3Q3U3Q1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ulk3Q3U3Q1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ulk3Q3U3Q1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ulk3Q3U3Q1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Ulk3Q3U3Q1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ulk3Q3U3Q1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ulk3Q3U3Q1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Ulk3Q3U3Q1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms