Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ogfod1Q3U0K8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ogfod1Q3U0K8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ogfod1Q3U0K8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Ogfod1Q3U0K8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ogfod1Q3U0K8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ogfod1Q3U0K8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Ogfod1Q3U0K8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ogfod1Q3U0K8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ogfod1Q3U0K8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ogfod1Q3U0K8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ogfod1Q3U0K8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Ogfod1Q3U0K8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Ogfod1Q3U0K8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Ogfod1Q3U0K8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ogfod1Q3U0K8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ogfod1Q3U0K8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Ogfod1Q3U0K8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ogfod1Q3U0K8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ogfod1Q3U0K8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ogfod1Q3U0K8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ogfod1Q3U0K8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ogfod1Q3U0K8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ogfod1Q3U0K8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ogfod1Q3U0K8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ogfod1Q3U0K8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ogfod1Q3U0K8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ogfod1Q3U0K8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Ogfod1Q3U0K8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ogfod1Q3U0K8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ogfod1Q3U0K8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ogfod1Q3U0K8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ogfod1Q3U0K8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ogfod1Q3U0K8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ogfod1Q3U0K8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ogfod1Q3U0K8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ogfod1Q3U0K8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ogfod1Q3U0K8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ogfod1Q3U0K8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ogfod1Q3U0K8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ogfod1Q3U0K8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ogfod1Q3U0K8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ogfod1Q3U0K8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ogfod1Q3U0K8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ogfod1Q3U0K8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ogfod1Q3U0K8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ogfod1Q3U0K8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ogfod1Q3U0K8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Ogfod1Q3U0K8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ogfod1Q3U0K8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ogfod1Q3U0K8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ogfod1Q3U0K8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ogfod1Q3U0K8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ogfod1Q3U0K8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,8 ms