Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TchpQ3TVW5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TchpQ3TVW5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TchpQ3TVW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TchpQ3TVW5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TchpQ3TVW5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TchpQ3TVW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TchpQ3TVW5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TchpQ3TVW5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TchpQ3TVW5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TchpQ3TVW5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TchpQ3TVW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TchpQ3TVW5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TchpQ3TVW5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TchpQ3TVW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TchpQ3TVW5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TchpQ3TVW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TchpQ3TVW5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TchpQ3TVW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TchpQ3TVW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TchpQ3TVW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TchpQ3TVW5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TchpQ3TVW5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TchpQ3TVW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TchpQ3TVW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TchpQ3TVW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TchpQ3TVW5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms