Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt2Q3TTY5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt2Q3TTY5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt2Q3TTY5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt2Q3TTY5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt2Q3TTY5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt2Q3TTY5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt2Q3TTY5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt2Q3TTY5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt2Q3TTY5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt2Q3TTY5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt2Q3TTY5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt2Q3TTY5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt2Q3TTY5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt2Q3TTY5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt2Q3TTY5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt2Q3TTY5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt2Q3TTY5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt2Q3TTY5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt2Q3TTY5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt2Q3TTY5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt2Q3TTY5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt2Q3TTY5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt2Q3TTY5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt2Q3TTY5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt2Q3TTY5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt2Q3TTY5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt2Q3TTY5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt2Q3TTY5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt2Q3TTY5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt2Q3TTY5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt2Q3TTY5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt2Q3TTY5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt2Q3TTY5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt2Q3TTY5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt2Q3TTY5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt2Q3TTY5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt2Q3TTY5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt2Q3TTY5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt2Q3TTY5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt2Q3TTY5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt2Q3TTY5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms