Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
RubcnlQ3TD16 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
RubcnlQ3TD16 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,22■■■□□ 2,59
RubcnlQ3TD16 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
RubcnlQ3TD16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
RubcnlQ3TD16 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
RubcnlQ3TD16 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
RubcnlQ3TD16 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
RubcnlQ3TD16 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
RubcnlQ3TD16 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
RubcnlQ3TD16 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
RubcnlQ3TD16 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
RubcnlQ3TD16 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
RubcnlQ3TD16 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
RubcnlQ3TD16 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
RubcnlQ3TD16 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
RubcnlQ3TD16 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
RubcnlQ3TD16 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,05■■■□□ 2,56
RubcnlQ3TD16 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
RubcnlQ3TD16 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
RubcnlQ3TD16 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
RubcnlQ3TD16 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
RubcnlQ3TD16 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
RubcnlQ3TD16 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,95■■■□□ 2,54
RubcnlQ3TD16 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
RubcnlQ3TD16 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
RubcnlQ3TD16 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
RubcnlQ3TD16 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
RubcnlQ3TD16 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
RubcnlQ3TD16 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
RubcnlQ3TD16 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
RubcnlQ3TD16 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
RubcnlQ3TD16 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
RubcnlQ3TD16 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
RubcnlQ3TD16 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
RubcnlQ3TD16 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
RubcnlQ3TD16 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
RubcnlQ3TD16 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
RubcnlQ3TD16 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
RubcnlQ3TD16 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
RubcnlQ3TD16 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
RubcnlQ3TD16 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,75■■■□□ 2,51
RubcnlQ3TD16 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
RubcnlQ3TD16 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
RubcnlQ3TD16 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
RubcnlQ3TD16 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
RubcnlQ3TD16 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
RubcnlQ3TD16 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
RubcnlQ3TD16 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
RubcnlQ3TD16 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
RubcnlQ3TD16 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
RubcnlQ3TD16 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
RubcnlQ3TD16 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,49
RubcnlQ3TD16 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
RubcnlQ3TD16 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,46■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,46■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
RubcnlQ3TD16 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30,39■■■□□ 2,46
RubcnlQ3TD16 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,36■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
RubcnlQ3TD16 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
RubcnlQ3TD16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,4 ms