Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc127Q3TC33 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc127Q3TC33 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc127Q3TC33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc127Q3TC33 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc127Q3TC33 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc127Q3TC33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc127Q3TC33 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc127Q3TC33 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc127Q3TC33 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc127Q3TC33 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc127Q3TC33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc127Q3TC33 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc127Q3TC33 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc127Q3TC33 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc127Q3TC33 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc127Q3TC33 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc127Q3TC33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc127Q3TC33 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc127Q3TC33 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc127Q3TC33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc127Q3TC33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc127Q3TC33 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc127Q3TC33 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc127Q3TC33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc127Q3TC33 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc127Q3TC33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc127Q3TC33 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc127Q3TC33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc127Q3TC33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc127Q3TC33 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc127Q3TC33 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc127Q3TC33 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc127Q3TC33 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc127Q3TC33 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc127Q3TC33 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc127Q3TC33 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc127Q3TC33 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc127Q3TC33 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc127Q3TC33 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc127Q3TC33 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc127Q3TC33 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc127Q3TC33 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc127Q3TC33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc127Q3TC33 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc127Q3TC33 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms