Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpne9Q1RLL3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpne9Q1RLL3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpne9Q1RLL3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne9Q1RLL3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpne9Q1RLL3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpne9Q1RLL3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpne9Q1RLL3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne9Q1RLL3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpne9Q1RLL3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpne9Q1RLL3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpne9Q1RLL3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cpne9Q1RLL3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne9Q1RLL3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne9Q1RLL3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne9Q1RLL3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne9Q1RLL3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne9Q1RLL3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpne9Q1RLL3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne9Q1RLL3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne9Q1RLL3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne9Q1RLL3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne9Q1RLL3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne9Q1RLL3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpne9Q1RLL3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne9Q1RLL3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne9Q1RLL3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne9Q1RLL3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne9Q1RLL3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpne9Q1RLL3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpne9Q1RLL3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpne9Q1RLL3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne9Q1RLL3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpne9Q1RLL3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpne9Q1RLL3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpne9Q1RLL3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cpne9Q1RLL3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpne9Q1RLL3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpne9Q1RLL3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cpne9Q1RLL3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpne9Q1RLL3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpne9Q1RLL3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpne9Q1RLL3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpne9Q1RLL3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpne9Q1RLL3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpne9Q1RLL3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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