Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 UBA4YHR111W 1323 nt12.2□□□□□ -0.46
SRF1Q12516 YSR3YKR053C 1215 nt12.19□□□□□ -0.46
SRF1Q12516 MEP2YNL142W 1500 nt12.19□□□□□ -0.46
SRF1Q12516 IRC15YPL017C 1500 nt12.18□□□□□ -0.46
SRF1Q12516 YNR029CYNR029C 1290 nt12.17□□□□□ -0.46
SRF1Q12516 CSM2YIL132C 642 nt12.12□□□□□ -0.47
SRF1Q12516 XYL2YLR070C 1071 nt12.12□□□□□ -0.47
SRF1Q12516 CCT4YDL143W 1587 nt12.09□□□□□ -0.47
SRF1Q12516 SWC5YBR231C 912 nt12.09□□□□□ -0.47
SRF1Q12516 YLL053CYLL053C 459 nt12.08□□□□□ -0.48
SRF1Q12516 FTR1YER145C 1215 nt12.07□□□□□ -0.48
SRF1Q12516 STE4YOR212W 1272 nt12.07□□□□□ -0.48
SRF1Q12516 STB1YNL309W 1263 nt12.06□□□□□ -0.48
SRF1Q12516 SHB17YKR043C 816 nt12.05□□□□□ -0.48
SRF1Q12516 GAL1YBR020W 1587 nt12.05□□□□□ -0.48
SRF1Q12516 YLR111WYLR111W 333 nt12.04□□□□□ -0.48
SRF1Q12516 YCR087WYCR087W 516 nt12.01□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 ADH7YCR105W 1086 nt12.01□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 SPC25YER018C 666 nt12.01□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 GPI16YHR188C 1833 nt12.01□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 SPT8YLR055C 1809 nt12.01□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 DCW1YKL046C 1350 nt12.01□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 PAU15YIR041W 375 nt12□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 GIS3YLR094C 1509 nt12□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 TRM5YHR070W 1500 nt11.98□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.98□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 ALG3YBL082C 1377 nt11.96□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 YLR349WYLR349W 507 nt11.96□□□□□ -0.49
SRF1Q12516 AIM45YPR004C 1035 nt11.95□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 EMI2YDR516C 1503 nt11.95□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 YDL221WYDL221W 552 nt11.94□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 VPS60YDR486C 690 nt11.94□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 SPT5YML010W 3192 nt11.92□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 TIM17YJL143W 477 nt11.91□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 DDR2YOL052C-A 186 nt11.91□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 PAU21YOR394W 495 nt11.91□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 PAU22YPL282C 495 nt11.91□□□□□ -0.5
SRF1Q12516 YMR090WYMR090W 684 nt11.89□□□□□ -0.51
SRF1Q12516 PHO89YBR296C 1725 nt11.89□□□□□ -0.51
SRF1Q12516 BIO4YNR057C 714 nt11.87□□□□□ -0.51
SRF1Q12516 YDR010CYDR010C 333 nt11.83□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 RET2YFR051C 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 SIM1YIL123W 1431 nt11.81□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 MRP20YDR405W 792 nt11.81□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 FUN14YAL008W 597 nt11.81□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 ARO7YPR060C 771 nt11.81□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 YFL067WYFL067W 528 nt11.79□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 FEN2YCR028C 1539 nt11.79□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 YNL195CYNL195C 786 nt11.78□□□□□ -0.52
SRF1Q12516 YLR279WYLR279W 390 nt11.76□□□□□ -0.53
SRF1Q12516 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.75□□□□□ -0.53
SRF1Q12516 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.73□□□□□ -0.53
SRF1Q12516 SDH5YOL071W 489 nt11.73□□□□□ -0.53
SRF1Q12516 ATF2YGR177C 1608 nt11.72□□□□□ -0.53
SRF1Q12516 YJL195CYJL195C 702 nt11.71□□□□□ -0.53
SRF1Q12516 SCC4YER147C 1875 nt11.7□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 ESS1YJR017C 513 nt11.7□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 PAM17YKR065C 594 nt11.69□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 NAP1YKR048C 1254 nt11.68□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 GPN2YOR262W 1044 nt11.68□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 RAD23YEL037C 1197 nt11.67□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 SHM2YLR058C 1410 nt11.67□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 YIR016WYIR016W 798 nt11.65□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 ERF2YLR246W 1080 nt11.65□□□□□ -0.54
SRF1Q12516 SGT2YOR007C 1041 nt11.64□□□□□ -0.55
SRF1Q12516 ANP1YEL036C 1503 nt11.64□□□□□ -0.55
SRF1Q12516 COQ2YNR041C 1119 nt11.63□□□□□ -0.55
SRF1Q12516 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.61□□□□□ -0.55
SRF1Q12516 CPD1YGR247W 720 nt11.6□□□□□ -0.55
SRF1Q12516 PUP1YOR157C 786 nt11.59□□□□□ -0.55
SRF1Q12516 SDH1YKL148C 1923 nt11.58□□□□□ -0.55
SRF1Q12516 SEN2YLR105C 1134 nt11.58□□□□□ -0.56
SRF1Q12516 REG2YBR050C 1017 nt11.57□□□□□ -0.56
SRF1Q12516 RPL4BYDR012W 1089 nt11.56□□□□□ -0.56
SRF1Q12516 RPL4AYBR031W 1089 nt11.56□□□□□ -0.56
SRF1Q12516 CLB6YGR109C 1143 nt11.53□□□□□ -0.56
SRF1Q12516 XDJ1YLR090W 1380 nt11.53□□□□□ -0.56
SRF1Q12516 NIT1YIL164C 600 nt11.52□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 RIB3YDR487C 627 nt11.5□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 YEL008WYEL008W 381 nt11.5□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 CRR1YLR213C 1269 nt11.5□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 YJR114WYJR114W 393 nt11.49□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 SNG1YGR197C 1644 nt11.46□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 HEM12YDR047W 1089 nt11.46□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 ADH1YOL086C 1047 nt11.46□□□□□ -0.57
SRF1Q12516 SSA4YER103W 1929 nt11.45□□□□□ -0.58
SRF1Q12516 RRT12YCR045C 1476 nt11.44□□□□□ -0.58
SRF1Q12516 GDH3YAL062W 1374 nt11.44□□□□□ -0.58
SRF1Q12516 VAR1Q0140 1197 nt11.43□□□□□ -0.58
SRF1Q12516 RPS14BYJL191W 417 nt11.43□□□□□ -0.58
SRF1Q12516 YGR012WYGR012W 1182 nt11.4□□□□□ -0.58
SRF1Q12516 TSC10YBR265W 963 nt11.4□□□□□ -0.58
SRF1Q12516 CAB5YDR196C 726 nt11.39□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 SFA1YDL168W 1161 nt11.38□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 YDR509WYDR509W 348 nt11.37□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.37□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 YPI1YFR003C 468 nt11.36□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 UTH1YKR042W 1098 nt11.36□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 TIM44YIL022W 1296 nt11.35□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 BUR6YER159C 429 nt11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.1 ms