Protein–RNA interactions for Protein: Q12298

YDR061W, Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein YDR061W, yeastyeast

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR061WQ12298 YFL054CYFL054C 1941 nt10.55□□□□□ -0.72
YDR061WQ12298 TAD3YLR316C 969 nt10.51□□□□□ -0.73
YDR061WQ12298 PCM1YEL058W 1674 nt10.5□□□□□ -0.73
YDR061WQ12298 RNQ1YCL028W 1218 nt10.47□□□□□ -0.73
YDR061WQ12298 MCH5YOR306C 1566 nt10.45□□□□□ -0.74
YDR061WQ12298 NAT4YMR069W 858 nt10.44□□□□□ -0.74
YDR061WQ12298 YIH1YCR059C 777 nt10.43□□□□□ -0.74
YDR061WQ12298 AHT1YHR093W 549 nt10.42□□□□□ -0.74
YDR061WQ12298 WSC2YNL283C 1512 nt10.42□□□□□ -0.74
YDR061WQ12298 PEX25YPL112C 1185 nt10.4□□□□□ -0.74
YDR061WQ12298 GLK1YCL040W 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
YDR061WQ12298 YFL066CYFL066C 1179 nt10.38□□□□□ -0.75
YDR061WQ12298 ALG12YNR030W 1656 nt10.38□□□□□ -0.75
YDR061WQ12298 HSP60YLR259C 1719 nt10.37□□□□□ -0.75
YDR061WQ12298 AQY1YPR192W 918 nt10.35□□□□□ -0.75
YDR061WQ12298 SWE1YJL187C 2460 nt10.34□□□□□ -0.75
YDR061WQ12298 YLL053CYLL053C 459 nt10.31□□□□□ -0.76
YDR061WQ12298 LYS4YDR234W 2082 nt10.3□□□□□ -0.76
YDR061WQ12298 YLR415CYLR415C 339 nt10.3□□□□□ -0.76
YDR061WQ12298 YNL115CYNL115C 1935 nt10.29□□□□□ -0.76
YDR061WQ12298 FTR1YER145C 1215 nt10.28□□□□□ -0.76
YDR061WQ12298 YSP3YOR003W 1437 nt10.27□□□□□ -0.77
YDR061WQ12298 MSF1YPR047W 1410 nt10.26□□□□□ -0.77
YDR061WQ12298 BDH1YAL060W 1149 nt10.26□□□□□ -0.77
YDR061WQ12298 GAL1YBR020W 1587 nt10.24□□□□□ -0.77
YDR061WQ12298 BIO4YNR057C 714 nt10.24□□□□□ -0.77
YDR061WQ12298 THI74YDR438W 1113 nt10.23□□□□□ -0.77
YDR061WQ12298 SIM1YIL123W 1431 nt10.23□□□□□ -0.77
YDR061WQ12298 TRM5YHR070W 1500 nt10.2□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 STB1YNL309W 1263 nt10.2□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 CCT4YDL143W 1587 nt10.18□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 MIR1YJR077C 936 nt10.18□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 SWC5YBR231C 912 nt10.18□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 GPI16YHR188C 1833 nt10.17□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.17□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 SPC25YER018C 666 nt10.17□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 VPS75YNL246W 795 nt10.17□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 DDR2YOL052C-A 186 nt10.16□□□□□ -0.78
YDR061WQ12298 YMR244WYMR244W 1068 nt10.14□□□□□ -0.79
YDR061WQ12298 YFL067WYFL067W 528 nt10.11□□□□□ -0.79
YDR061WQ12298 PAU7YAR020C 168 nt10.11□□□□□ -0.79
YDR061WQ12298 VPS60YDR486C 690 nt10.1□□□□□ -0.79
YDR061WQ12298 NAR1YNL240C 1476 nt10.09□□□□□ -0.79
YDR061WQ12298 GLR1YPL091W 1452 nt10.09□□□□□ -0.79
YDR061WQ12298 ERF2YLR246W 1080 nt10.08□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 DAT1YML113W 747 nt10.07□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 ATF2YGR177C 1608 nt10.07□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 FUR4YBR021W 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.04□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 ALG3YBL082C 1377 nt10.03□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.03□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 CRR1YLR213C 1269 nt10.03□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 FEN2YCR028C 1539 nt10.02□□□□□ -0.8
YDR061WQ12298 AAC1YMR056C 930 nt10.02□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 YGL034CYGL034C 366 nt10.01□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 TIM17YJL143W 477 nt9.99□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 UBA4YHR111W 1323 nt9.98□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 RBG2YGR173W 1107 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 YSR3YKR053C 1215 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 PRP4YPR178W 1398 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 ANP1YEL036C 1503 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 NDI1YML120C 1542 nt9.97□□□□□ -0.81
YDR061WQ12298 CCA1YER168C 1641 nt9.94□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 RPM1RPM1 483 nt9.94□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 SHB17YKR043C 816 nt9.93□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 HEM12YDR047W 1089 nt9.92□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 YIR016WYIR016W 798 nt9.91□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 RBG1YAL036C 1110 nt9.91□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 SNG1YGR197C 1644 nt9.91□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 DPS1YLL018C 1674 nt9.9□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 MIC10YCL057C-A 294 nt9.9□□□□□ -0.82
YDR061WQ12298 RAX1YOR301W 1308 nt9.89□□□□□ -0.83
YDR061WQ12298 XYL2YLR070C 1071 nt9.88□□□□□ -0.83
YDR061WQ12298 BMT6YLR063W 1098 nt9.87□□□□□ -0.83
YDR061WQ12298 YCR087WYCR087W 516 nt9.85□□□□□ -0.83
YDR061WQ12298 SHM2YLR058C 1410 nt9.84□□□□□ -0.83
YDR061WQ12298 CMP2YML057W 1815 nt9.84□□□□□ -0.83
YDR061WQ12298 CYT2YKL087C 675 nt9.83□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 YMR226CYMR226C 804 nt9.82□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 BIO5YNR056C 1686 nt9.81□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 XDJ1YLR090W 1380 nt9.8□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 PHO89YBR296C 1725 nt9.8□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 YDR010CYDR010C 333 nt9.79□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 SGT2YOR007C 1041 nt9.79□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 AIM45YPR004C 1035 nt9.79□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 PBP1YGR178C 2169 nt9.78□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 SNF1YDR477W 1902 nt9.78□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 BNA2YJR078W 1362 nt9.78□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 YKR005CYKR005C 1578 nt9.78□□□□□ -0.84
YDR061WQ12298 RET2YFR051C 1641 nt9.77□□□□□ -0.85
YDR061WQ12298 SAM1YLR180W 1149 nt9.73□□□□□ -0.85
YDR061WQ12298 GDH3YAL062W 1374 nt9.73□□□□□ -0.85
YDR061WQ12298 MRP20YDR405W 792 nt9.72□□□□□ -0.85
YDR061WQ12298 NIT1YIL164C 600 nt9.71□□□□□ -0.86
YDR061WQ12298 YLR111WYLR111W 333 nt9.71□□□□□ -0.86
YDR061WQ12298 AGP1YCL025C 1902 nt9.7□□□□□ -0.86
YDR061WQ12298 MIC12YBR262C 321 nt9.68□□□□□ -0.86
YDR061WQ12298 YCL074WYCL074W 927 nt9.66□□□□□ -0.86
YDR061WQ12298 YGR259CYGR259C 441 nt9.65□□□□□ -0.86
YDR061WQ12298 YGR201CYGR201C 678 nt9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.8 ms