Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 DDR2YOL052C-A 186 nt9.51□□□□□ -0.89
USB1Q12208 HEM12YDR047W 1089 nt9.49□□□□□ -0.89
USB1Q12208 TRM5YHR070W 1500 nt9.49□□□□□ -0.89
USB1Q12208 ATF2YGR177C 1608 nt9.49□□□□□ -0.89
USB1Q12208 UME6YDR207C 2511 nt9.46□□□□□ -0.9
USB1Q12208 SPT8YLR055C 1809 nt9.45□□□□□ -0.9
USB1Q12208 YPR064WYPR064W 420 nt9.45□□□□□ -0.9
USB1Q12208 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.43□□□□□ -0.9
USB1Q12208 SNG1YGR197C 1644 nt9.42□□□□□ -0.9
USB1Q12208 HUA1YGR268C 597 nt9.41□□□□□ -0.9
USB1Q12208 STB1YNL309W 1263 nt9.41□□□□□ -0.9
USB1Q12208 SPC25YER018C 666 nt9.4□□□□□ -0.9
USB1Q12208 GPI16YHR188C 1833 nt9.4□□□□□ -0.91
USB1Q12208 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.39□□□□□ -0.91
USB1Q12208 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.39□□□□□ -0.91
USB1Q12208 AHT1YHR093W 549 nt9.39□□□□□ -0.91
USB1Q12208 MIC10YCL057C-A 294 nt9.38□□□□□ -0.91
USB1Q12208 RAX1YOR301W 1308 nt9.37□□□□□ -0.91
USB1Q12208 ANP1YEL036C 1503 nt9.37□□□□□ -0.91
USB1Q12208 WSC2YNL283C 1512 nt9.36□□□□□ -0.91
USB1Q12208 TAD3YLR316C 969 nt9.35□□□□□ -0.91
USB1Q12208 BNA2YJR078W 1362 nt9.35□□□□□ -0.91
USB1Q12208 FEN2YCR028C 1539 nt9.33□□□□□ -0.92
USB1Q12208 CCT4YDL143W 1587 nt9.33□□□□□ -0.92
USB1Q12208 SWE1YJL187C 2460 nt9.31□□□□□ -0.92
USB1Q12208 SWC5YBR231C 912 nt9.31□□□□□ -0.92
USB1Q12208 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.3□□□□□ -0.92
USB1Q12208 VPS60YDR486C 690 nt9.29□□□□□ -0.92
USB1Q12208 RPM1RPM1 483 nt9.29□□□□□ -0.92
USB1Q12208 YIR016WYIR016W 798 nt9.25□□□□□ -0.93
USB1Q12208 MIC12YBR262C 321 nt9.23□□□□□ -0.93
USB1Q12208 YLR415CYLR415C 339 nt9.21□□□□□ -0.94
USB1Q12208 YDR094WYDR094W 336 nt9.2□□□□□ -0.94
USB1Q12208 ALG3YBL082C 1377 nt9.2□□□□□ -0.94
USB1Q12208 HHO1YPL127C 777 nt9.19□□□□□ -0.94
USB1Q12208 CCA1YER168C 1641 nt9.18□□□□□ -0.94
USB1Q12208 YGR201CYGR201C 678 nt9.16□□□□□ -0.94
USB1Q12208 BDH1YAL060W 1149 nt9.16□□□□□ -0.94
USB1Q12208 UBX6YJL048C 1191 nt9.15□□□□□ -0.94
USB1Q12208 YSP3YOR003W 1437 nt9.09□□□□□ -0.95
USB1Q12208 TIM17YJL143W 477 nt9.09□□□□□ -0.95
USB1Q12208 XDJ1YLR090W 1380 nt9.09□□□□□ -0.95
USB1Q12208 DUS1YML080W 1272 nt9.07□□□□□ -0.96
USB1Q12208 BOR1YNL275W 1731 nt9.07□□□□□ -0.96
USB1Q12208 YFR018CYFR018C 1092 nt9.06□□□□□ -0.96
USB1Q12208 GDH3YAL062W 1374 nt9.06□□□□□ -0.96
USB1Q12208 GOR1YNL274C 1053 nt9.05□□□□□ -0.96
USB1Q12208 PEX25YPL112C 1185 nt9.05□□□□□ -0.96
USB1Q12208 YNL115CYNL115C 1935 nt9.03□□□□□ -0.96
USB1Q12208 FUR4YBR021W 1902 nt9.03□□□□□ -0.96
USB1Q12208 AGP1YCL025C 1902 nt9.03□□□□□ -0.96
USB1Q12208 SHM2YLR058C 1410 nt9.02□□□□□ -0.97
USB1Q12208 AVT6YER119C 1347 nt9.02□□□□□ -0.97
USB1Q12208 GLK1YCL040W 1503 nt9.01□□□□□ -0.97
USB1Q12208 YCL074WYCL074W 927 nt9.01□□□□□ -0.97
USB1Q12208 HSP60YLR259C 1719 nt9□□□□□ -0.97
USB1Q12208 VPS75YNL246W 795 nt8.98□□□□□ -0.97
USB1Q12208 RRT5YFR032C 870 nt8.96□□□□□ -0.98
USB1Q12208 YFL066CYFL066C 1179 nt8.95□□□□□ -0.98
USB1Q12208 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.91□□□□□ -0.98
USB1Q12208 DAT1YML113W 747 nt8.91□□□□□ -0.98
USB1Q12208 PRP4YPR178W 1398 nt8.9□□□□□ -0.98
USB1Q12208 NIT1YIL164C 600 nt8.9□□□□□ -0.98
USB1Q12208 PAU16YKL224C 372 nt8.9□□□□□ -0.98
USB1Q12208 BMT6YLR063W 1098 nt8.9□□□□□ -0.98
USB1Q12208 PAU7YAR020C 168 nt8.9□□□□□ -0.98
USB1Q12208 STR3YGL184C 1398 nt8.89□□□□□ -0.99
USB1Q12208 SGT2YOR007C 1041 nt8.89□□□□□ -0.99
USB1Q12208 DUT1YBR252W 444 nt8.89□□□□□ -0.99
USB1Q12208 YCR102CYCR102C 1107 nt8.88□□□□□ -0.99
USB1Q12208 AQY2YLL052C 450 nt8.88□□□□□ -0.99
USB1Q12208 PRE6YOL038W 765 nt8.87□□□□□ -0.99
USB1Q12208 YKR005CYKR005C 1578 nt8.86□□□□□ -0.99
USB1Q12208 YGR259CYGR259C 441 nt8.84□□□□□ -0.99
USB1Q12208 DPS1YLL018C 1674 nt8.84□□□□□ -0.99
USB1Q12208 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.83□□□□□ -1
USB1Q12208 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.83□□□□□ -1
USB1Q12208 AAC1YMR056C 930 nt8.8□□□□□ -1
USB1Q12208 RTN2YDL204W 1182 nt8.79□□□□□ -1
USB1Q12208 NBP35YGL091C 987 nt8.77□□□□□ -1.01
USB1Q12208 MCH5YOR306C 1566 nt8.74□□□□□ -1.01
USB1Q12208 IRC24YIR036C 792 nt8.74□□□□□ -1.01
USB1Q12208 MIR1YJR077C 936 nt8.74□□□□□ -1.01
USB1Q12208 NAT4YMR069W 858 nt8.74□□□□□ -1.01
USB1Q12208 SHB17YKR043C 816 nt8.73□□□□□ -1.01
USB1Q12208 FRE6YLL051C 2139 nt8.72□□□□□ -1.01
USB1Q12208 THI74YDR438W 1113 nt8.72□□□□□ -1.01
USB1Q12208 TIR3YIL011W 810 nt8.71□□□□□ -1.02
USB1Q12208 ALG12YNR030W 1656 nt8.69□□□□□ -1.02
USB1Q12208 LSC2YGR244C 1284 nt8.69□□□□□ -1.02
USB1Q12208 UBA4YHR111W 1323 nt8.69□□□□□ -1.02
USB1Q12208 YDR010CYDR010C 333 nt8.68□□□□□ -1.02
USB1Q12208 ARP6YLR085C 1317 nt8.68□□□□□ -1.02
USB1Q12208 RET2YFR051C 1641 nt8.67□□□□□ -1.02
USB1Q12208 SSN3YPL042C 1668 nt8.66□□□□□ -1.02
USB1Q12208 MSF1YPR047W 1410 nt8.66□□□□□ -1.02
USB1Q12208 YCR087WYCR087W 516 nt8.65□□□□□ -1.02
USB1Q12208 YSR3YKR053C 1215 nt8.65□□□□□ -1.02
USB1Q12208 PHO89YBR296C 1725 nt8.63□□□□□ -1.03
USB1Q12208 PLB1YMR008C 1995 nt8.63□□□□□ -1.03
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