Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 ATF2YGR177C 1608 nt10.37□□□□□ -0.75
PUS9Q12069 CRR1YLR213C 1269 nt10.37□□□□□ -0.75
PUS9Q12069 TAD3YLR316C 969 nt10.37□□□□□ -0.75
PUS9Q12069 WSC2YNL283C 1512 nt10.36□□□□□ -0.75
PUS9Q12069 STB1YNL309W 1263 nt10.35□□□□□ -0.75
PUS9Q12069 YJL225CYJL225C 5277 nt10.34□□□□□ -0.75
PUS9Q12069 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.32□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.31□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 HEM12YDR047W 1089 nt10.31□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 SPC25YER018C 666 nt10.31□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 LYS4YDR234W 2082 nt10.3□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 GPI16YHR188C 1833 nt10.3□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 PTK1YKL198C 1989 nt10.3□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 YDR094WYDR094W 336 nt10.28□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 UBX6YJL048C 1191 nt10.28□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 CCT4YDL143W 1587 nt10.27□□□□□ -0.76
PUS9Q12069 SNG1YGR197C 1644 nt10.26□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 RPM1RPM1 483 nt10.25□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 SWC5YBR231C 912 nt10.25□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 MIC10YCL057C-A 294 nt10.24□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 FEN2YCR028C 1539 nt10.23□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 ANP1YEL036C 1503 nt10.23□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 VPS60YDR486C 690 nt10.22□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 YFL054CYFL054C 1941 nt10.21□□□□□ -0.77
PUS9Q12069 YLR415CYLR415C 339 nt10.2□□□□□ -0.78
PUS9Q12069 BOR1YNL275W 1731 nt10.17□□□□□ -0.78
PUS9Q12069 BDH1YAL060W 1149 nt10.17□□□□□ -0.78
PUS9Q12069 BNA2YJR078W 1362 nt10.16□□□□□ -0.78
PUS9Q12069 YFR018CYFR018C 1092 nt10.16□□□□□ -0.78
PUS9Q12069 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.16□□□□□ -0.78
PUS9Q12069 ALG3YBL082C 1377 nt10.14□□□□□ -0.79
PUS9Q12069 YIR016WYIR016W 798 nt10.14□□□□□ -0.79
PUS9Q12069 MCH5YOR306C 1566 nt10.14□□□□□ -0.79
PUS9Q12069 RRT5YFR032C 870 nt10.13□□□□□ -0.79
PUS9Q12069 RAX1YOR301W 1308 nt10.12□□□□□ -0.79
PUS9Q12069 YSP3YOR003W 1437 nt10.11□□□□□ -0.79
PUS9Q12069 PEX25YPL112C 1185 nt10.1□□□□□ -0.79
PUS9Q12069 YNL115CYNL115C 1935 nt10.08□□□□□ -0.8
PUS9Q12069 YFL066CYFL066C 1179 nt10.07□□□□□ -0.8
PUS9Q12069 SPT8YLR055C 1809 nt10.05□□□□□ -0.8
PUS9Q12069 PRE6YOL038W 765 nt10.05□□□□□ -0.8
PUS9Q12069 PAU16YKL224C 372 nt10.03□□□□□ -0.8
PUS9Q12069 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.03□□□□□ -0.8
PUS9Q12069 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.03□□□□□ -0.8
PUS9Q12069 MIC12YBR262C 321 nt10.02□□□□□ -0.81
PUS9Q12069 TIM17YJL143W 477 nt10.01□□□□□ -0.81
PUS9Q12069 HHO1YPL127C 777 nt10□□□□□ -0.81
PUS9Q12069 VPS75YNL246W 795 nt9.97□□□□□ -0.81
PUS9Q12069 XDJ1YLR090W 1380 nt9.97□□□□□ -0.81
PUS9Q12069 YGR201CYGR201C 678 nt9.95□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 SWE1YJL187C 2460 nt9.94□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 GDH3YAL062W 1374 nt9.93□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.93□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 SHM2YLR058C 1410 nt9.92□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 YGR139WYGR139W 339 nt9.91□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 PAU7YAR020C 168 nt9.91□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 CCA1YER168C 1641 nt9.9□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 GLK1YCL040W 1503 nt9.9□□□□□ -0.82
PUS9Q12069 AVT6YER119C 1347 nt9.87□□□□□ -0.83
PUS9Q12069 NAT4YMR069W 858 nt9.87□□□□□ -0.83
PUS9Q12069 GOR1YNL274C 1053 nt9.86□□□□□ -0.83
PUS9Q12069 SGT2YOR007C 1041 nt9.83□□□□□ -0.84
PUS9Q12069 MIR1YJR077C 936 nt9.81□□□□□ -0.84
PUS9Q12069 THI74YDR438W 1113 nt9.8□□□□□ -0.84
PUS9Q12069 NIT1YIL164C 600 nt9.8□□□□□ -0.84
PUS9Q12069 DUS1YML080W 1272 nt9.8□□□□□ -0.84
PUS9Q12069 AGP1YCL025C 1902 nt9.8□□□□□ -0.84
PUS9Q12069 ALG12YNR030W 1656 nt9.77□□□□□ -0.85
PUS9Q12069 MSF1YPR047W 1410 nt9.76□□□□□ -0.85
PUS9Q12069 SHB17YKR043C 816 nt9.73□□□□□ -0.85
PUS9Q12069 DAT1YML113W 747 nt9.73□□□□□ -0.85
PUS9Q12069 DUT1YBR252W 444 nt9.73□□□□□ -0.85
PUS9Q12069 YCR102CYCR102C 1107 nt9.71□□□□□ -0.86
PUS9Q12069 UBA4YHR111W 1323 nt9.71□□□□□ -0.86
PUS9Q12069 YCL074WYCL074W 927 nt9.68□□□□□ -0.86
PUS9Q12069 YSR3YKR053C 1215 nt9.67□□□□□ -0.86
PUS9Q12069 YDR010CYDR010C 333 nt9.66□□□□□ -0.86
PUS9Q12069 HSP60YLR259C 1719 nt9.65□□□□□ -0.86
PUS9Q12069 AQY2YLL052C 450 nt9.65□□□□□ -0.86
PUS9Q12069 FUR4YBR021W 1902 nt9.64□□□□□ -0.87
PUS9Q12069 STR3YGL184C 1398 nt9.63□□□□□ -0.87
PUS9Q12069 PHO89YBR296C 1725 nt9.62□□□□□ -0.87
PUS9Q12069 YGL034CYGL034C 366 nt9.62□□□□□ -0.87
PUS9Q12069 RET2YFR051C 1641 nt9.62□□□□□ -0.87
PUS9Q12069 YCR087WYCR087W 516 nt9.6□□□□□ -0.87
PUS9Q12069 NBP35YGL091C 987 nt9.58□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 XYL2YLR070C 1071 nt9.58□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.56□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.56□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 SBA1YKL117W 651 nt9.56□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 MRP20YDR405W 792 nt9.55□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.53□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 TIR3YIL011W 810 nt9.53□□□□□ -0.88
PUS9Q12069 RBG1YAL036C 1110 nt9.51□□□□□ -0.89
PUS9Q12069 SFA1YDL168W 1161 nt9.5□□□□□ -0.89
PUS9Q12069 AIM45YPR004C 1035 nt9.5□□□□□ -0.89
PUS9Q12069 NDI1YML120C 1542 nt9.5□□□□□ -0.89
PUS9Q12069 NAR1YNL240C 1476 nt9.49□□□□□ -0.89
PUS9Q12069 RTN2YDL204W 1182 nt9.47□□□□□ -0.89
PUS9Q12069 COQ2YNR041C 1119 nt9.47□□□□□ -0.89
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