Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 NCP1YHR042W 2076 nt10.78□□□□□ -0.68
TRM8Q12009 GAL1YBR020W 1587 nt10.77□□□□□ -0.69
TRM8Q12009 TRM5YHR070W 1500 nt10.73□□□□□ -0.69
TRM8Q12009 PTK1YKL198C 1989 nt10.72□□□□□ -0.69
TRM8Q12009 ERF2YLR246W 1080 nt10.7□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 ATF2YGR177C 1608 nt10.69□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 SPC25YER018C 666 nt10.68□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 PAU16YKL224C 372 nt10.68□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 PRE6YOL038W 765 nt10.68□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 YFL067WYFL067W 528 nt10.66□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 RRT5YFR032C 870 nt10.66□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 STB1YNL309W 1263 nt10.66□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 BDH1YAL060W 1149 nt10.65□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 CRR1YLR213C 1269 nt10.65□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 DDR2YOL052C-A 186 nt10.65□□□□□ -0.7
TRM8Q12009 CCT4YDL143W 1587 nt10.63□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 YSP3YOR003W 1437 nt10.62□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.62□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 PEX25YPL112C 1185 nt10.62□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 LYS4YDR234W 2082 nt10.62□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 GPI16YHR188C 1833 nt10.61□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 YFL054CYFL054C 1941 nt10.61□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.59□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 YFL066CYFL066C 1179 nt10.59□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 YLR415CYLR415C 339 nt10.59□□□□□ -0.71
TRM8Q12009 ANP1YEL036C 1503 nt10.58□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 VPS60YDR486C 690 nt10.57□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 BOR1YNL275W 1731 nt10.55□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 RPM1RPM1 483 nt10.55□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 MCH5YOR306C 1566 nt10.55□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 SNG1YGR197C 1644 nt10.55□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 YNL115CYNL115C 1935 nt10.54□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 FEN2YCR028C 1539 nt10.54□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 SWC5YBR231C 912 nt10.54□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 HEM12YDR047W 1089 nt10.53□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 ALG3YBL082C 1377 nt10.52□□□□□ -0.72
TRM8Q12009 MIC10YCL057C-A 294 nt10.51□□□□□ -0.73
TRM8Q12009 SPT8YLR055C 1809 nt10.47□□□□□ -0.73
TRM8Q12009 YIR016WYIR016W 798 nt10.44□□□□□ -0.74
TRM8Q12009 VPS75YNL246W 795 nt10.43□□□□□ -0.74
TRM8Q12009 SBA1YKL117W 651 nt10.39□□□□□ -0.75
TRM8Q12009 NAT4YMR069W 858 nt10.39□□□□□ -0.75
TRM8Q12009 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.37□□□□□ -0.75
TRM8Q12009 MIR1YJR077C 936 nt10.36□□□□□ -0.75
TRM8Q12009 GLK1YCL040W 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
TRM8Q12009 YJL225CYJL225C 5277 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 TIM17YJL143W 477 nt10.32□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 MIC12YBR262C 321 nt10.32□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 MSF1YPR047W 1410 nt10.32□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 SWE1YJL187C 2460 nt10.31□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 THI74YDR438W 1113 nt10.31□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 BNA2YJR078W 1362 nt10.3□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 RAX1YOR301W 1308 nt10.29□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 SHM2YLR058C 1410 nt10.28□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 XDJ1YLR090W 1380 nt10.27□□□□□ -0.76
TRM8Q12009 PAU7YAR020C 168 nt10.23□□□□□ -0.77
TRM8Q12009 YGR201CYGR201C 678 nt10.21□□□□□ -0.77
TRM8Q12009 DAT1YML113W 747 nt10.21□□□□□ -0.77
TRM8Q12009 NIT1YIL164C 600 nt10.2□□□□□ -0.78
TRM8Q12009 GDH3YAL062W 1374 nt10.2□□□□□ -0.78
TRM8Q12009 HHO1YPL127C 777 nt10.19□□□□□ -0.78
TRM8Q12009 UBA4YHR111W 1323 nt10.17□□□□□ -0.78
TRM8Q12009 SHB17YKR043C 816 nt10.17□□□□□ -0.78
TRM8Q12009 SGT2YOR007C 1041 nt10.17□□□□□ -0.78
TRM8Q12009 CCA1YER168C 1641 nt10.17□□□□□ -0.78
TRM8Q12009 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.15□□□□□ -0.79
TRM8Q12009 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.15□□□□□ -0.79
TRM8Q12009 YGL034CYGL034C 366 nt10.13□□□□□ -0.79
TRM8Q12009 ALG12YNR030W 1656 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM8Q12009 YDR010CYDR010C 333 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM8Q12009 YSR3YKR053C 1215 nt10.1□□□□□ -0.79
TRM8Q12009 AVT6YER119C 1347 nt10.08□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 AGP1YCL025C 1902 nt10.07□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 RET2YFR051C 1641 nt10.07□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 FRE6YLL051C 2139 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 DUS1YML080W 1272 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 YMR244WYMR244W 1068 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 GOR1YNL274C 1053 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 XYL2YLR070C 1071 nt10.03□□□□□ -0.8
TRM8Q12009 FUR4YBR021W 1902 nt10.02□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 PHO89YBR296C 1725 nt10.01□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 GLR1YPL091W 1452 nt10□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 YCR087WYCR087W 516 nt10□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 DUT1YBR252W 444 nt10□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 HSP60YLR259C 1719 nt9.99□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 YCR102CYCR102C 1107 nt9.98□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 NDI1YML120C 1542 nt9.97□□□□□ -0.81
TRM8Q12009 RBG1YAL036C 1110 nt9.96□□□□□ -0.82
TRM8Q12009 AIM45YPR004C 1035 nt9.95□□□□□ -0.82
TRM8Q12009 SFA1YDL168W 1161 nt9.91□□□□□ -0.82
TRM8Q12009 COQ2YNR041C 1119 nt9.91□□□□□ -0.82
TRM8Q12009 YCL074WYCL074W 927 nt9.9□□□□□ -0.82
TRM8Q12009 MRP20YDR405W 792 nt9.89□□□□□ -0.83
TRM8Q12009 NBP35YGL091C 987 nt9.88□□□□□ -0.83
TRM8Q12009 PRP4YPR178W 1398 nt9.86□□□□□ -0.83
TRM8Q12009 RBG2YGR173W 1107 nt9.85□□□□□ -0.83
TRM8Q12009 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.85□□□□□ -0.83
TRM8Q12009 TIR3YIL011W 810 nt9.84□□□□□ -0.83
TRM8Q12009 STR3YGL184C 1398 nt9.84□□□□□ -0.83
TRM8Q12009 AQY2YLL052C 450 nt9.83□□□□□ -0.84
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