Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930480E11RikQ0VG34 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930480E11RikQ0VG34 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930480E11RikQ0VG34 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930480E11RikQ0VG34 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930480E11RikQ0VG34 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930480E11RikQ0VG34 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930480E11RikQ0VG34 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930480E11RikQ0VG34 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930480E11RikQ0VG34 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930480E11RikQ0VG34 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930480E11RikQ0VG34 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930480E11RikQ0VG34 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
4930480E11RikQ0VG34 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930480E11RikQ0VG34 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930480E11RikQ0VG34 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930480E11RikQ0VG34 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930480E11RikQ0VG34 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930480E11RikQ0VG34 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930480E11RikQ0VG34 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930480E11RikQ0VG34 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930480E11RikQ0VG34 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930480E11RikQ0VG34 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930480E11RikQ0VG34 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930480E11RikQ0VG34 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930480E11RikQ0VG34 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930480E11RikQ0VG34 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930480E11RikQ0VG34 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930480E11RikQ0VG34 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930480E11RikQ0VG34 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930480E11RikQ0VG34 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930480E11RikQ0VG34 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930480E11RikQ0VG34 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930480E11RikQ0VG34 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms