Protein–RNA interactions for Protein: Q0EEE2

Ptchd3, Patched domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd3Q0EEE2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptchd3Q0EEE2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptchd3Q0EEE2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptchd3Q0EEE2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptchd3Q0EEE2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptchd3Q0EEE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptchd3Q0EEE2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptchd3Q0EEE2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptchd3Q0EEE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptchd3Q0EEE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptchd3Q0EEE2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptchd3Q0EEE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptchd3Q0EEE2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptchd3Q0EEE2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptchd3Q0EEE2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptchd3Q0EEE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptchd3Q0EEE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ptchd3Q0EEE2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptchd3Q0EEE2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptchd3Q0EEE2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptchd3Q0EEE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptchd3Q0EEE2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptchd3Q0EEE2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptchd3Q0EEE2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptchd3Q0EEE2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptchd3Q0EEE2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptchd3Q0EEE2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms