Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plac8l1Q08EJ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plac8l1Q08EJ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plac8l1Q08EJ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plac8l1Q08EJ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plac8l1Q08EJ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plac8l1Q08EJ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Plac8l1Q08EJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plac8l1Q08EJ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plac8l1Q08EJ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plac8l1Q08EJ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plac8l1Q08EJ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plac8l1Q08EJ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plac8l1Q08EJ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Plac8l1Q08EJ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plac8l1Q08EJ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plac8l1Q08EJ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plac8l1Q08EJ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plac8l1Q08EJ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plac8l1Q08EJ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms