Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YSP3YOR003W 1437 nt11.31□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 YNL115CYNL115C 1935 nt11.3□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 YHL050CYHL050C 2094 nt11.29□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 BDH1YAL060W 1149 nt11.28□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 THI74YDR438W 1113 nt11.24□□□□□ -0.61
SGO1Q08490 MIR1YJR077C 936 nt11.24□□□□□ -0.61
SGO1Q08490 UME6YDR207C 2511 nt11.24□□□□□ -0.61
SGO1Q08490 PTK1YKL198C 1989 nt11.22□□□□□ -0.61
SGO1Q08490 YLR415CYLR415C 339 nt11.19□□□□□ -0.62
SGO1Q08490 AQY1YPR192W 918 nt11.18□□□□□ -0.62
SGO1Q08490 YLL053CYLL053C 459 nt11.17□□□□□ -0.62
SGO1Q08490 BOP3YNL042W 1191 nt11.16□□□□□ -0.62
SGO1Q08490 RRT12YCR045C 1476 nt11.15□□□□□ -0.62
SGO1Q08490 GLR1YPL091W 1452 nt11.14□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 FTR1YER145C 1215 nt11.14□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 BOR1YNL275W 1731 nt11.13□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 GAL1YBR020W 1587 nt11.11□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 YJL225CYJL225C 5277 nt11.11□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 VPS75YNL246W 795 nt11.1□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 DAT1YML113W 747 nt11.09□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 BIO4YNR057C 714 nt11.09□□□□□ -0.63
SGO1Q08490 RBG2YGR173W 1107 nt11.08□□□□□ -0.64
SGO1Q08490 CCT4YDL143W 1587 nt11.07□□□□□ -0.64
SGO1Q08490 TRM5YHR070W 1500 nt11.06□□□□□ -0.64
SGO1Q08490 STB1YNL309W 1263 nt11.06□□□□□ -0.64
SGO1Q08490 SPC25YER018C 666 nt11.05□□□□□ -0.64
SGO1Q08490 YGL034CYGL034C 366 nt11.02□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 SWC5YBR231C 912 nt10.99□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 SIM1YIL123W 1431 nt10.99□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 VPS60YDR486C 690 nt10.98□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 YNL195CYNL195C 786 nt10.98□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 GPI16YHR188C 1833 nt10.98□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 ALG3YBL082C 1377 nt10.96□□□□□ -0.65
SGO1Q08490 SPT8YLR055C 1809 nt10.95□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 UBA4YHR111W 1323 nt10.94□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 NCP1YHR042W 2076 nt10.94□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 NDI1YML120C 1542 nt10.94□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 PAU7YAR020C 168 nt10.93□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 ATF2YGR177C 1608 nt10.93□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 YFL054CYFL054C 1941 nt10.92□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 DDR2YOL052C-A 186 nt10.91□□□□□ -0.66
SGO1Q08490 RBG1YAL036C 1110 nt10.87□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 SHB17YKR043C 816 nt10.87□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 YSR3YKR053C 1215 nt10.87□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 MCH5YOR306C 1566 nt10.86□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 YFL067WYFL067W 528 nt10.86□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 XYL2YLR070C 1071 nt10.86□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 FEN2YCR028C 1539 nt10.85□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.85□□□□□ -0.67
SGO1Q08490 ERF2YLR246W 1080 nt10.82□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 ANP1YEL036C 1503 nt10.82□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 SAM1YLR180W 1149 nt10.81□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 TIM17YJL143W 477 nt10.79□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 CRR1YLR213C 1269 nt10.79□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 YDR010CYDR010C 333 nt10.78□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 RAD51YER095W 1203 nt10.78□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 YMR226CYMR226C 804 nt10.78□□□□□ -0.68
SGO1Q08490 HSP60YLR259C 1719 nt10.75□□□□□ -0.69
SGO1Q08490 ALG12YNR030W 1656 nt10.74□□□□□ -0.69
SGO1Q08490 YIR016WYIR016W 798 nt10.74□□□□□ -0.69
SGO1Q08490 RPM1RPM1 483 nt10.72□□□□□ -0.69
SGO1Q08490 SNG1YGR197C 1644 nt10.72□□□□□ -0.69
SGO1Q08490 AIM45YPR004C 1035 nt10.71□□□□□ -0.69
SGO1Q08490 SHM2YLR058C 1410 nt10.7□□□□□ -0.7
SGO1Q08490 PHO89YBR296C 1725 nt10.7□□□□□ -0.7
SGO1Q08490 YCR087WYCR087W 516 nt10.69□□□□□ -0.7
SGO1Q08490 RET2YFR051C 1641 nt10.69□□□□□ -0.7
SGO1Q08490 MIC10YCL057C-A 294 nt10.67□□□□□ -0.7
SGO1Q08490 SGT2YOR007C 1041 nt10.66□□□□□ -0.7
SGO1Q08490 HEM12YDR047W 1089 nt10.64□□□□□ -0.71
SGO1Q08490 NIT1YIL164C 600 nt10.64□□□□□ -0.71
SGO1Q08490 SWE1YJL187C 2460 nt10.64□□□□□ -0.71
SGO1Q08490 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
SGO1Q08490 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
SGO1Q08490 XDJ1YLR090W 1380 nt10.61□□□□□ -0.71
SGO1Q08490 YNR029CYNR029C 1290 nt10.58□□□□□ -0.72
SGO1Q08490 YLR111WYLR111W 333 nt10.57□□□□□ -0.72
SGO1Q08490 LYS4YDR234W 2082 nt10.56□□□□□ -0.72
SGO1Q08490 COQ2YNR041C 1119 nt10.55□□□□□ -0.72
SGO1Q08490 MRP20YDR405W 792 nt10.54□□□□□ -0.72
SGO1Q08490 YLR349WYLR349W 507 nt10.52□□□□□ -0.73
SGO1Q08490 STE4YOR212W 1272 nt10.51□□□□□ -0.73
SGO1Q08490 GDH3YAL062W 1374 nt10.5□□□□□ -0.73
SGO1Q08490 MIC12YBR262C 321 nt10.45□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 NAR1YNL240C 1476 nt10.43□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 SFA1YDL168W 1161 nt10.43□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.43□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 BNA2YJR078W 1362 nt10.42□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 ADH7YCR105W 1086 nt10.41□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 SDH5YOL071W 489 nt10.41□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 CAB5YDR196C 726 nt10.4□□□□□ -0.74
SGO1Q08490 FUR4YBR021W 1902 nt10.39□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 RPL4BYDR012W 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 RAD23YEL037C 1197 nt10.38□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 PAU15YIR041W 375 nt10.38□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 RPL4AYBR031W 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.37□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 YGR201CYGR201C 678 nt10.36□□□□□ -0.75
SGO1Q08490 FUN14YAL008W 597 nt10.36□□□□□ -0.75
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