Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 SWE1YJL187C 2460 nt11.11□□□□□ -0.63
CUE5Q08412 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.1□□□□□ -0.63
CUE5Q08412 RTG1YOL067C 534 nt11.1□□□□□ -0.63
CUE5Q08412 STB1YNL309W 1263 nt11.08□□□□□ -0.64
CUE5Q08412 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.07□□□□□ -0.64
CUE5Q08412 WSC2YNL283C 1512 nt11.05□□□□□ -0.64
CUE5Q08412 RAX1YOR301W 1308 nt11.05□□□□□ -0.64
CUE5Q08412 ANP1YEL036C 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
CUE5Q08412 SPC25YER018C 666 nt11.04□□□□□ -0.64
CUE5Q08412 AHT1YHR093W 549 nt11.02□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 YPR064WYPR064W 420 nt11.02□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 GPI16YHR188C 1833 nt11□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 FEN2YCR028C 1539 nt11□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 VPS60YDR486C 690 nt10.98□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.98□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 YEL076CYEL076C 651 nt10.98□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 YLR464WYLR464W 651 nt10.98□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 BNA2YJR078W 1362 nt10.97□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 CCT4YDL143W 1587 nt10.97□□□□□ -0.65
CUE5Q08412 CCA1YER168C 1641 nt10.95□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 TAD3YLR316C 969 nt10.94□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 SWC5YBR231C 912 nt10.93□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 ALG3YBL082C 1377 nt10.92□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.92□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.92□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 HUA1YGR268C 597 nt10.92□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 YIR016WYIR016W 798 nt10.91□□□□□ -0.66
CUE5Q08412 MRPL8YJL063C 717 nt10.89□□□□□ -0.67
CUE5Q08412 MIC12YBR262C 321 nt10.89□□□□□ -0.67
CUE5Q08412 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.85□□□□□ -0.67
CUE5Q08412 ADO1YJR105W 1023 nt10.85□□□□□ -0.67
CUE5Q08412 HHO1YPL127C 777 nt10.83□□□□□ -0.68
CUE5Q08412 BDH1YAL060W 1149 nt10.8□□□□□ -0.68
CUE5Q08412 BOR1YNL275W 1731 nt10.8□□□□□ -0.68
CUE5Q08412 AGP1YCL025C 1902 nt10.79□□□□□ -0.68
CUE5Q08412 YLR415CYLR415C 339 nt10.78□□□□□ -0.68
CUE5Q08412 FUR4YBR021W 1902 nt10.78□□□□□ -0.68
CUE5Q08412 HSP60YLR259C 1719 nt10.75□□□□□ -0.69
CUE5Q08412 DUS1YML080W 1272 nt10.73□□□□□ -0.69
CUE5Q08412 GLK1YCL040W 1503 nt10.73□□□□□ -0.69
CUE5Q08412 YGR201CYGR201C 678 nt10.72□□□□□ -0.69
CUE5Q08412 XDJ1YLR090W 1380 nt10.72□□□□□ -0.69
CUE5Q08412 RPM1RPM1 483 nt10.7□□□□□ -0.7
CUE5Q08412 YSP3YOR003W 1437 nt10.69□□□□□ -0.7
CUE5Q08412 GDH3YAL062W 1374 nt10.67□□□□□ -0.7
CUE5Q08412 DUT1YBR252W 444 nt10.67□□□□□ -0.7
CUE5Q08412 UME6YDR207C 2511 nt10.65□□□□□ -0.7
CUE5Q08412 AVT6YER119C 1347 nt10.65□□□□□ -0.7
CUE5Q08412 SHM2YLR058C 1410 nt10.64□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 YNL115CYNL115C 1935 nt10.63□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 YCL074WYCL074W 927 nt10.62□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 TIM17YJL143W 477 nt10.62□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 GOR1YNL274C 1053 nt10.62□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 PEX25YPL112C 1185 nt10.6□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 YFL066CYFL066C 1179 nt10.59□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 PRP4YPR178W 1398 nt10.59□□□□□ -0.71
CUE5Q08412 STR3YGL184C 1398 nt10.55□□□□□ -0.72
CUE5Q08412 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.55□□□□□ -0.72
CUE5Q08412 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.55□□□□□ -0.72
CUE5Q08412 YKR005CYKR005C 1578 nt10.53□□□□□ -0.72
CUE5Q08412 AQY2YLL052C 450 nt10.53□□□□□ -0.72
CUE5Q08412 YFR018CYFR018C 1092 nt10.52□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 NIT1YIL164C 600 nt10.52□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 DPS1YLL018C 1674 nt10.51□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 PRE6YOL038W 765 nt10.51□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 SGT2YOR007C 1041 nt10.5□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 YGR259CYGR259C 441 nt10.48□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 BMT6YLR063W 1098 nt10.48□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 VPS75YNL246W 795 nt10.48□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 YDR094WYDR094W 336 nt10.46□□□□□ -0.73
CUE5Q08412 DAT1YML113W 747 nt10.45□□□□□ -0.74
CUE5Q08412 AAC1YMR056C 930 nt10.44□□□□□ -0.74
CUE5Q08412 FRE6YLL051C 2139 nt10.42□□□□□ -0.74
CUE5Q08412 YCR102CYCR102C 1107 nt10.4□□□□□ -0.74
CUE5Q08412 RRT5YFR032C 870 nt10.4□□□□□ -0.74
CUE5Q08412 UBX6YJL048C 1191 nt10.39□□□□□ -0.75
CUE5Q08412 ALG12YNR030W 1656 nt10.38□□□□□ -0.75
CUE5Q08412 PAU7YAR020C 168 nt10.37□□□□□ -0.75
CUE5Q08412 SNF1YDR477W 1902 nt10.35□□□□□ -0.75
CUE5Q08412 RTN2YDL204W 1182 nt10.35□□□□□ -0.75
CUE5Q08412 NBP35YGL091C 987 nt10.35□□□□□ -0.75
CUE5Q08412 PAU16YKL224C 372 nt10.34□□□□□ -0.75
CUE5Q08412 IRC24YIR036C 792 nt10.32□□□□□ -0.76
CUE5Q08412 BIO5YNR056C 1686 nt10.27□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 MIR1YJR077C 936 nt10.26□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 SHB17YKR043C 816 nt10.26□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 YDR010CYDR010C 333 nt10.25□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 MCH5YOR306C 1566 nt10.24□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 PLB1YMR008C 1995 nt10.24□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 SHH4YLR164W 507 nt10.23□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 ARP6YLR085C 1317 nt10.22□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 TIR3YIL011W 810 nt10.21□□□□□ -0.77
CUE5Q08412 THI74YDR438W 1113 nt10.19□□□□□ -0.78
CUE5Q08412 UBA4YHR111W 1323 nt10.18□□□□□ -0.78
CUE5Q08412 PRO1YDR300C 1287 nt10.16□□□□□ -0.78
CUE5Q08412 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.16□□□□□ -0.78
CUE5Q08412 RET2YFR051C 1641 nt10.15□□□□□ -0.78
CUE5Q08412 SFA1YDL168W 1161 nt10.15□□□□□ -0.78
CUE5Q08412 NAT4YMR069W 858 nt10.15□□□□□ -0.78
CUE5Q08412 NAR1YNL240C 1476 nt10.15□□□□□ -0.78
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