Protein–RNA interactions for Protein: Q07794

RTT109, Histone acetyltransferase RTT109, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT109Q07794 YDR094WYDR094W 336 nt13.78□□□□□ -0.2
RTT109Q07794 AQY1YPR192W 918 nt13.78□□□□□ -0.2
RTT109Q07794 MIC10YCL057C-A 294 nt13.77□□□□□ -0.21
RTT109Q07794 STB1YNL309W 1263 nt13.76□□□□□ -0.21
RTT109Q07794 DDR2YOL052C-A 186 nt13.75□□□□□ -0.21
RTT109Q07794 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.73□□□□□ -0.21
RTT109Q07794 YFL067WYFL067W 528 nt13.73□□□□□ -0.21
RTT109Q07794 SNG1YGR197C 1644 nt13.72□□□□□ -0.21
RTT109Q07794 SPC25YER018C 666 nt13.72□□□□□ -0.21
RTT109Q07794 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.69□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 CCT4YDL143W 1587 nt13.68□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 HEM12YDR047W 1089 nt13.67□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 BDH1YAL060W 1149 nt13.67□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 PRE6YOL038W 765 nt13.67□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 VPS60YDR486C 690 nt13.66□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 ANP1YEL036C 1503 nt13.65□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 ALG3YBL082C 1377 nt13.65□□□□□ -0.22
RTT109Q07794 GPI16YHR188C 1833 nt13.62□□□□□ -0.23
RTT109Q07794 FEN2YCR028C 1539 nt13.62□□□□□ -0.23
RTT109Q07794 YFL066CYFL066C 1179 nt13.6□□□□□ -0.23
RTT109Q07794 YFR018CYFR018C 1092 nt13.6□□□□□ -0.23
RTT109Q07794 YSP3YOR003W 1437 nt13.58□□□□□ -0.24
RTT109Q07794 YFL054CYFL054C 1941 nt13.56□□□□□ -0.24
RTT109Q07794 SWC5YBR231C 912 nt13.56□□□□□ -0.24
RTT109Q07794 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.53□□□□□ -0.24
RTT109Q07794 PAU16YKL224C 372 nt13.53□□□□□ -0.24
RTT109Q07794 YLR415CYLR415C 339 nt13.53□□□□□ -0.24
RTT109Q07794 PEX25YPL112C 1185 nt13.51□□□□□ -0.25
RTT109Q07794 YNL115CYNL115C 1935 nt13.51□□□□□ -0.25
RTT109Q07794 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.5□□□□□ -0.25
RTT109Q07794 YIR016WYIR016W 798 nt13.5□□□□□ -0.25
RTT109Q07794 SPT8YLR055C 1809 nt13.42□□□□□ -0.26
RTT109Q07794 RRT5YFR032C 870 nt13.4□□□□□ -0.26
RTT109Q07794 RAX1YOR301W 1308 nt13.39□□□□□ -0.27
RTT109Q07794 MIC12YBR262C 321 nt13.37□□□□□ -0.27
RTT109Q07794 BNA2YJR078W 1362 nt13.33□□□□□ -0.27
RTT109Q07794 SWE1YJL187C 2460 nt13.29□□□□□ -0.28
RTT109Q07794 XDJ1YLR090W 1380 nt13.29□□□□□ -0.28
RTT109Q07794 SHM2YLR058C 1410 nt13.27□□□□□ -0.29
RTT109Q07794 CCA1YER168C 1641 nt13.25□□□□□ -0.29
RTT109Q07794 VPS75YNL246W 795 nt13.24□□□□□ -0.29
RTT109Q07794 HHO1YPL127C 777 nt13.23□□□□□ -0.29
RTT109Q07794 AGP1YCL025C 1902 nt13.23□□□□□ -0.29
RTT109Q07794 TIM17YJL143W 477 nt13.22□□□□□ -0.29
RTT109Q07794 MIR1YJR077C 936 nt13.19□□□□□ -0.3
RTT109Q07794 GDH3YAL062W 1374 nt13.19□□□□□ -0.3
RTT109Q07794 DUT1YBR252W 444 nt13.18□□□□□ -0.3
RTT109Q07794 NIT1YIL164C 600 nt13.17□□□□□ -0.3
RTT109Q07794 YGR201CYGR201C 678 nt13.14□□□□□ -0.31
RTT109Q07794 SGT2YOR007C 1041 nt13.14□□□□□ -0.31
RTT109Q07794 AVT6YER119C 1347 nt13.1□□□□□ -0.31
RTT109Q07794 NAT4YMR069W 858 nt13.09□□□□□ -0.31
RTT109Q07794 GLK1YCL040W 1503 nt13.08□□□□□ -0.31
RTT109Q07794 THI74YDR438W 1113 nt13.08□□□□□ -0.32
RTT109Q07794 SBA1YKL117W 651 nt13.04□□□□□ -0.32
RTT109Q07794 PAU7YAR020C 168 nt13.04□□□□□ -0.32
RTT109Q07794 MSF1YPR047W 1410 nt13.04□□□□□ -0.32
RTT109Q07794 SHB17YKR043C 816 nt13.03□□□□□ -0.32
RTT109Q07794 PAC11YDR488C 1602 nt13.01□□□□□ -0.33
RTT109Q07794 YDR010CYDR010C 333 nt13□□□□□ -0.33
RTT109Q07794 DAT1YML113W 747 nt13□□□□□ -0.33
RTT109Q07794 GOR1YNL274C 1053 nt12.98□□□□□ -0.33
RTT109Q07794 UBA4YHR111W 1323 nt12.96□□□□□ -0.33
RTT109Q07794 DUS1YML080W 1272 nt12.93□□□□□ -0.34
RTT109Q07794 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.88□□□□□ -0.35
RTT109Q07794 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.88□□□□□ -0.35
RTT109Q07794 STR3YGL184C 1398 nt12.86□□□□□ -0.35
RTT109Q07794 YGL034CYGL034C 366 nt12.86□□□□□ -0.35
RTT109Q07794 YSR3YKR053C 1215 nt12.85□□□□□ -0.35
RTT109Q07794 FUR4YBR021W 1902 nt12.85□□□□□ -0.35
RTT109Q07794 XYL2YLR070C 1071 nt12.84□□□□□ -0.35
RTT109Q07794 YCR102CYCR102C 1107 nt12.83□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 PHO89YBR296C 1725 nt12.82□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 RET2YFR051C 1641 nt12.82□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 YCL074WYCL074W 927 nt12.8□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 AQY2YLL052C 450 nt12.8□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 SFA1YDL168W 1161 nt12.79□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 NBP35YGL091C 987 nt12.79□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 SHH4YLR164W 507 nt12.79□□□□□ -0.36
RTT109Q07794 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.71□□□□□ -0.37
RTT109Q07794 COQ2YNR041C 1119 nt12.71□□□□□ -0.37
RTT109Q07794 RBG1YAL036C 1110 nt12.7□□□□□ -0.38
RTT109Q07794 HSP60YLR259C 1719 nt12.65□□□□□ -0.38
RTT109Q07794 NDI1YML120C 1542 nt12.64□□□□□ -0.39
RTT109Q07794 AIM45YPR004C 1035 nt12.64□□□□□ -0.39
RTT109Q07794 TIR3YIL011W 810 nt12.63□□□□□ -0.39
RTT109Q07794 YCR087WYCR087W 516 nt12.62□□□□□ -0.39
RTT109Q07794 MRP20YDR405W 792 nt12.6□□□□□ -0.39
RTT109Q07794 TOM6YOR045W 186 nt12.6□□□□□ -0.39
RTT109Q07794 YMR244WYMR244W 1068 nt12.59□□□□□ -0.39
RTT109Q07794 PRO1YDR300C 1287 nt12.58□□□□□ -0.4
RTT109Q07794 POM34YLR018C 900 nt12.58□□□□□ -0.4
RTT109Q07794 YKR005CYKR005C 1578 nt12.56□□□□□ -0.4
RTT109Q07794 GLR1YPL091W 1452 nt12.55□□□□□ -0.4
RTT109Q07794 ARP6YLR085C 1317 nt12.53□□□□□ -0.4
RTT109Q07794 PEX2YJL210W 816 nt12.52□□□□□ -0.41
RTT109Q07794 PRP4YPR178W 1398 nt12.52□□□□□ -0.41
RTT109Q07794 YGR259CYGR259C 441 nt12.51□□□□□ -0.41
RTT109Q07794 PLB1YMR008C 1995 nt12.5□□□□□ -0.41
RTT109Q07794 RTN2YDL204W 1182 nt12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms