Protein–RNA interactions for Protein: Q07457

BRE1, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE1Q07457 DDR2YOL052C-A 186 nt13.02□□□□□ -0.33
BRE1Q07457 TAD3YLR316C 969 nt12.97□□□□□ -0.33
BRE1Q07457 STB1YNL309W 1263 nt12.97□□□□□ -0.33
BRE1Q07457 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.96□□□□□ -0.33
BRE1Q07457 HEM12YDR047W 1089 nt12.95□□□□□ -0.34
BRE1Q07457 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.94□□□□□ -0.34
BRE1Q07457 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.94□□□□□ -0.34
BRE1Q07457 SNG1YGR197C 1644 nt12.93□□□□□ -0.34
BRE1Q07457 SPC25YER018C 666 nt12.93□□□□□ -0.34
BRE1Q07457 MIC10YCL057C-A 294 nt12.93□□□□□ -0.34
BRE1Q07457 YFL054CYFL054C 1941 nt12.9□□□□□ -0.35
BRE1Q07457 GPI16YHR188C 1833 nt12.89□□□□□ -0.35
BRE1Q07457 CCT4YDL143W 1587 nt12.88□□□□□ -0.35
BRE1Q07457 ANP1YEL036C 1503 nt12.87□□□□□ -0.35
BRE1Q07457 FEN2YCR028C 1539 nt12.84□□□□□ -0.35
BRE1Q07457 VPS60YDR486C 690 nt12.84□□□□□ -0.35
BRE1Q07457 UBX6YJL048C 1191 nt12.83□□□□□ -0.36
BRE1Q07457 SWC5YBR231C 912 nt12.82□□□□□ -0.36
BRE1Q07457 NVJ2YPR091C 2313 nt12.82□□□□□ -0.36
BRE1Q07457 YDR094WYDR094W 336 nt12.8□□□□□ -0.36
BRE1Q07457 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.8□□□□□ -0.36
BRE1Q07457 BDH1YAL060W 1149 nt12.78□□□□□ -0.36
BRE1Q07457 ALG3YBL082C 1377 nt12.78□□□□□ -0.36
BRE1Q07457 YLR415CYLR415C 339 nt12.74□□□□□ -0.37
BRE1Q07457 SPT8YLR055C 1809 nt12.74□□□□□ -0.37
BRE1Q07457 YIR016WYIR016W 798 nt12.73□□□□□ -0.37
BRE1Q07457 RAX1YOR301W 1308 nt12.72□□□□□ -0.37
BRE1Q07457 YSP3YOR003W 1437 nt12.7□□□□□ -0.38
BRE1Q07457 BNA2YJR078W 1362 nt12.69□□□□□ -0.38
BRE1Q07457 YFR018CYFR018C 1092 nt12.69□□□□□ -0.38
BRE1Q07457 YFL066CYFL066C 1179 nt12.64□□□□□ -0.39
BRE1Q07457 PEX25YPL112C 1185 nt12.64□□□□□ -0.39
BRE1Q07457 YNL115CYNL115C 1935 nt12.64□□□□□ -0.39
BRE1Q07457 PRE6YOL038W 765 nt12.63□□□□□ -0.39
BRE1Q07457 MIC12YBR262C 321 nt12.62□□□□□ -0.39
BRE1Q07457 SWE1YJL187C 2460 nt12.6□□□□□ -0.39
BRE1Q07457 RRT5YFR032C 870 nt12.57□□□□□ -0.4
BRE1Q07457 PAU16YKL224C 372 nt12.55□□□□□ -0.4
BRE1Q07457 HHO1YPL127C 777 nt12.54□□□□□ -0.4
BRE1Q07457 PAC11YDR488C 1602 nt12.53□□□□□ -0.4
BRE1Q07457 XDJ1YLR090W 1380 nt12.52□□□□□ -0.41
BRE1Q07457 CCA1YER168C 1641 nt12.51□□□□□ -0.41
BRE1Q07457 TIM17YJL143W 477 nt12.49□□□□□ -0.41
BRE1Q07457 SHM2YLR058C 1410 nt12.47□□□□□ -0.41
BRE1Q07457 YGR201CYGR201C 678 nt12.46□□□□□ -0.41
BRE1Q07457 GDH3YAL062W 1374 nt12.45□□□□□ -0.42
BRE1Q07457 VPS75YNL246W 795 nt12.45□□□□□ -0.42
BRE1Q07457 AGP1YCL025C 1902 nt12.41□□□□□ -0.42
BRE1Q07457 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.4□□□□□ -0.42
BRE1Q07457 RPM1RPM1 483 nt12.38□□□□□ -0.43
BRE1Q07457 AVT6YER119C 1347 nt12.37□□□□□ -0.43
BRE1Q07457 NIT1YIL164C 600 nt12.34□□□□□ -0.43
BRE1Q07457 SGT2YOR007C 1041 nt12.33□□□□□ -0.44
BRE1Q07457 DUT1YBR252W 444 nt12.33□□□□□ -0.44
BRE1Q07457 PAU7YAR020C 168 nt12.32□□□□□ -0.44
BRE1Q07457 GOR1YNL274C 1053 nt12.32□□□□□ -0.44
BRE1Q07457 DUS1YML080W 1272 nt12.3□□□□□ -0.44
BRE1Q07457 GLK1YCL040W 1503 nt12.3□□□□□ -0.44
BRE1Q07457 MIR1YJR077C 936 nt12.29□□□□□ -0.44
BRE1Q07457 NAT4YMR069W 858 nt12.27□□□□□ -0.45
BRE1Q07457 THI74YDR438W 1113 nt12.23□□□□□ -0.45
BRE1Q07457 DAT1YML113W 747 nt12.22□□□□□ -0.45
BRE1Q07457 YJL225CYJL225C 5277 nt12.2□□□□□ -0.46
BRE1Q07457 FUR4YBR021W 1902 nt12.2□□□□□ -0.46
BRE1Q07457 SHB17YKR043C 816 nt12.2□□□□□ -0.46
BRE1Q07457 MSF1YPR047W 1410 nt12.18□□□□□ -0.46
BRE1Q07457 YCL074WYCL074W 927 nt12.17□□□□□ -0.46
BRE1Q07457 YCR102CYCR102C 1107 nt12.15□□□□□ -0.46
BRE1Q07457 STR3YGL184C 1398 nt12.15□□□□□ -0.46
BRE1Q07457 UBA4YHR111W 1323 nt12.14□□□□□ -0.47
BRE1Q07457 YDR010CYDR010C 333 nt12.14□□□□□ -0.47
BRE1Q07457 AQY2YLL052C 450 nt12.13□□□□□ -0.47
BRE1Q07457 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.11□□□□□ -0.47
BRE1Q07457 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.11□□□□□ -0.47
BRE1Q07457 YSR3YKR053C 1215 nt12.08□□□□□ -0.48
BRE1Q07457 FRE6YLL051C 2139 nt12.06□□□□□ -0.48
BRE1Q07457 NBP35YGL091C 987 nt12.05□□□□□ -0.48
BRE1Q07457 HSP60YLR259C 1719 nt12.05□□□□□ -0.48
BRE1Q07457 RET2YFR051C 1641 nt12.04□□□□□ -0.48
BRE1Q07457 PHO89YBR296C 1725 nt12.03□□□□□ -0.48
BRE1Q07457 YGL034CYGL034C 366 nt12.02□□□□□ -0.49
BRE1Q07457 XYL2YLR070C 1071 nt11.99□□□□□ -0.49
BRE1Q07457 BOR1YNL275W 1731 nt11.98□□□□□ -0.49
BRE1Q07457 PRP4YPR178W 1398 nt11.95□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 SFA1YDL168W 1161 nt11.95□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 YKR005CYKR005C 1578 nt11.95□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 TIR3YIL011W 810 nt11.94□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 SBA1YKL117W 651 nt11.94□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 SHH4YLR164W 507 nt11.94□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 YCR087WYCR087W 516 nt11.93□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.93□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 YGR259CYGR259C 441 nt11.91□□□□□ -0.5
BRE1Q07457 MRP20YDR405W 792 nt11.89□□□□□ -0.51
BRE1Q07457 COQ2YNR041C 1119 nt11.89□□□□□ -0.51
BRE1Q07457 RTN2YDL204W 1182 nt11.88□□□□□ -0.51
BRE1Q07457 RBG1YAL036C 1110 nt11.87□□□□□ -0.51
BRE1Q07457 AIM45YPR004C 1035 nt11.86□□□□□ -0.51
BRE1Q07457 DPS1YLL018C 1674 nt11.86□□□□□ -0.51
BRE1Q07457 ARP6YLR085C 1317 nt11.85□□□□□ -0.51
BRE1Q07457 PRO1YDR300C 1287 nt11.84□□□□□ -0.51
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