Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 Q0010Q0010 387 nt10.97□□□□□ -0.65
HDA3Q06623 PTH1YHR189W 573 nt10.96□□□□□ -0.65
HDA3Q06623 BUR6YER159C 429 nt10.95□□□□□ -0.66
HDA3Q06623 ADO1YJR105W 1023 nt10.94□□□□□ -0.66
HDA3Q06623 ATF2YGR177C 1608 nt10.94□□□□□ -0.66
HDA3Q06623 FTR1YER145C 1215 nt10.93□□□□□ -0.66
HDA3Q06623 GAL1YBR020W 1587 nt10.9□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 TRM5YHR070W 1500 nt10.89□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 MIC10YCL057C-A 294 nt10.89□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 HEM12YDR047W 1089 nt10.88□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 SWE1YJL187C 2460 nt10.87□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 YFL067WYFL067W 528 nt10.87□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 YLR235CYLR235C 399 nt10.87□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 SNG1YGR197C 1644 nt10.85□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.84□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 YEL076CYEL076C 651 nt10.84□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.84□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 YLR464WYLR464W 651 nt10.84□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 DDR2YOL052C-A 186 nt10.84□□□□□ -0.67
HDA3Q06623 TIM23YNR017W 669 nt10.83□□□□□ -0.68
HDA3Q06623 LCP5YER127W 1074 nt10.81□□□□□ -0.68
HDA3Q06623 YLR179CYLR179C 606 nt10.8□□□□□ -0.68
HDA3Q06623 ABZ2YMR289W 1125 nt10.8□□□□□ -0.68
HDA3Q06623 BMT5YIL096C 1011 nt10.79□□□□□ -0.68
HDA3Q06623 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.78□□□□□ -0.68
HDA3Q06623 TOM20YGR082W 552 nt10.78□□□□□ -0.68
HDA3Q06623 AQY1YPR192W 918 nt10.77□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 URH1YDR400W 1023 nt10.76□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 YKL030WYKL030W 606 nt10.76□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 RTG1YOL067C 534 nt10.76□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 RAX1YOR301W 1308 nt10.75□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 STB1YNL309W 1263 nt10.74□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 ANP1YEL036C 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.72□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.72□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 YJR154WYJR154W 1041 nt10.72□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 SRN2YLR119W 642 nt10.72□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 SPC25YER018C 666 nt10.71□□□□□ -0.69
HDA3Q06623 WSC2YNL283C 1512 nt10.69□□□□□ -0.7
HDA3Q06623 HUA1YGR268C 597 nt10.69□□□□□ -0.7
HDA3Q06623 AHT1YHR093W 549 nt10.68□□□□□ -0.7
HDA3Q06623 CCA1YER168C 1641 nt10.68□□□□□ -0.7
HDA3Q06623 FEN2YCR028C 1539 nt10.67□□□□□ -0.7
HDA3Q06623 GPI16YHR188C 1833 nt10.65□□□□□ -0.7
HDA3Q06623 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.65□□□□□ -0.7
HDA3Q06623 BNA2YJR078W 1362 nt10.64□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 VPS60YDR486C 690 nt10.63□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 YPR064WYPR064W 420 nt10.63□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 CCT4YDL143W 1587 nt10.63□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 BOR1YNL275W 1731 nt10.62□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 UBX6YJL048C 1191 nt10.6□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 MIC12YBR262C 321 nt10.6□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 YIR016WYIR016W 798 nt10.59□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 ALG3YBL082C 1377 nt10.59□□□□□ -0.71
HDA3Q06623 YJL118WYJL118W 660 nt10.57□□□□□ -0.72
HDA3Q06623 TAD3YLR316C 969 nt10.57□□□□□ -0.72
HDA3Q06623 SWC5YBR231C 912 nt10.57□□□□□ -0.72
HDA3Q06623 UME6YDR207C 2511 nt10.56□□□□□ -0.72
HDA3Q06623 HSP60YLR259C 1719 nt10.56□□□□□ -0.72
HDA3Q06623 FUR4YBR021W 1902 nt10.55□□□□□ -0.72
HDA3Q06623 HHO1YPL127C 777 nt10.52□□□□□ -0.73
HDA3Q06623 AGP1YCL025C 1902 nt10.52□□□□□ -0.73
HDA3Q06623 GLK1YCL040W 1503 nt10.51□□□□□ -0.73
HDA3Q06623 YDR094WYDR094W 336 nt10.49□□□□□ -0.73
HDA3Q06623 PAB1YER165W 1734 nt10.49□□□□□ -0.73
HDA3Q06623 BDH1YAL060W 1149 nt10.46□□□□□ -0.73
HDA3Q06623 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.44□□□□□ -0.74
HDA3Q06623 DUS1YML080W 1272 nt10.43□□□□□ -0.74
HDA3Q06623 YGR201CYGR201C 678 nt10.42□□□□□ -0.74
HDA3Q06623 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.41□□□□□ -0.74
HDA3Q06623 YLR415CYLR415C 339 nt10.4□□□□□ -0.74
HDA3Q06623 XDJ1YLR090W 1380 nt10.39□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 HMT1YBR034C 1047 nt10.39□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 ARP10YDR106W 855 nt10.38□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 DUT1YBR252W 444 nt10.38□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 PRP4YPR178W 1398 nt10.37□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 YCL074WYCL074W 927 nt10.36□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 GDH3YAL062W 1374 nt10.36□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 YHM2YMR241W 945 nt10.35□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 YSP3YOR003W 1437 nt10.34□□□□□ -0.75
HDA3Q06623 YPL041CYPL041C 624 nt10.33□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 UTP6YDR449C 1323 nt10.33□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 AVT6YER119C 1347 nt10.33□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 YDR509WYDR509W 348 nt10.32□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 COG1YGL223C 1254 nt10.32□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 SHM2YLR058C 1410 nt10.31□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 YKR005CYKR005C 1578 nt10.31□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 GOR1YNL274C 1053 nt10.3□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 DPS1YLL018C 1674 nt10.3□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 SEM1YDR363W-A 270 nt10.29□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 STR3YGL184C 1398 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 YPL071CYPL071C 471 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 FTH1YBR207W 1398 nt10.27□□□□□ -0.76
HDA3Q06623 TIM17YJL143W 477 nt10.26□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 YNL115CYNL115C 1935 nt10.25□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.24□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 YGR259CYGR259C 441 nt10.24□□□□□ -0.77
HDA3Q06623 ALG12YNR030W 1656 nt10.23□□□□□ -0.77
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