Protein–RNA interactions for Protein: Q05789

ATG38, Autophagy-related protein 38, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG38Q05789 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.32□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 YKL030WYKL030W 606 nt10.32□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 SPP1YPL138C 1062 nt10.32□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 BNA2YJR078W 1362 nt10.31□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.31□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 RAX1YOR301W 1308 nt10.31□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 SNG1YGR197C 1644 nt10.29□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 SSN3YPL042C 1668 nt10.29□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 SWE1YJL187C 2460 nt10.28□□□□□ -0.76
ATG38Q05789 GPI16YHR188C 1833 nt10.27□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 MCH5YOR306C 1566 nt10.26□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 STB1YNL309W 1263 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 YPR064WYPR064W 420 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 MIC10YCL057C-A 294 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 SPC25YER018C 666 nt10.22□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 ANP1YEL036C 1503 nt10.22□□□□□ -0.77
ATG38Q05789 SWC5YBR231C 912 nt10.18□□□□□ -0.78
ATG38Q05789 FEN2YCR028C 1539 nt10.17□□□□□ -0.78
ATG38Q05789 BOR1YNL275W 1731 nt10.17□□□□□ -0.78
ATG38Q05789 AHT1YHR093W 549 nt10.16□□□□□ -0.78
ATG38Q05789 CCT4YDL143W 1587 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG38Q05789 TAD3YLR316C 969 nt10.12□□□□□ -0.79
ATG38Q05789 VPS60YDR486C 690 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG38Q05789 HUA1YGR268C 597 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG38Q05789 WSC2YNL283C 1512 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG38Q05789 CCA1YER168C 1641 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG38Q05789 HHO1YPL127C 777 nt10.09□□□□□ -0.79
ATG38Q05789 MIC12YBR262C 321 nt10.09□□□□□ -0.79
ATG38Q05789 YIR016WYIR016W 798 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 ADO1YJR105W 1023 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 RTG1YOL067C 534 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.05□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 YEL076CYEL076C 651 nt10.05□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.05□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 YGR201CYGR201C 678 nt10.05□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 MRPL8YJL063C 717 nt10.05□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 YLR464WYLR464W 651 nt10.05□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 DUS1YML080W 1272 nt10.04□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 BSP1YPR171W 1731 nt10.03□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 GLK1YCL040W 1503 nt10.02□□□□□ -0.8
ATG38Q05789 GID7YCL039W 2238 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG38Q05789 YLR415CYLR415C 339 nt10.01□□□□□ -0.81
ATG38Q05789 FUR4YBR021W 1902 nt10□□□□□ -0.81
ATG38Q05789 HSP60YLR259C 1719 nt10□□□□□ -0.81
ATG38Q05789 ALG3YBL082C 1377 nt9.99□□□□□ -0.81
ATG38Q05789 BMT6YLR063W 1098 nt9.96□□□□□ -0.82
ATG38Q05789 YCL074WYCL074W 927 nt9.95□□□□□ -0.82
ATG38Q05789 GOR1YNL274C 1053 nt9.94□□□□□ -0.82
ATG38Q05789 XDJ1YLR090W 1380 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG38Q05789 TIM17YJL143W 477 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG38Q05789 PRP4YPR178W 1398 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG38Q05789 AVT6YER119C 1347 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG38Q05789 GDH3YAL062W 1374 nt9.88□□□□□ -0.83
ATG38Q05789 BDH1YAL060W 1149 nt9.88□□□□□ -0.83
ATG38Q05789 UBX6YJL048C 1191 nt9.87□□□□□ -0.83
ATG38Q05789 AGP1YCL025C 1902 nt9.86□□□□□ -0.83
ATG38Q05789 AAC1YMR056C 930 nt9.82□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 YKR005CYKR005C 1578 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 SHM2YLR058C 1410 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 DPS1YLL018C 1674 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 YGR259CYGR259C 441 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 YSP3YOR003W 1437 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 ESBP6YNL125C 2022 nt9.78□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 AQY2YLL052C 450 nt9.78□□□□□ -0.84
ATG38Q05789 PEX25YPL112C 1185 nt9.77□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 MET2YNL277W 1461 nt9.77□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 YNL115CYNL115C 1935 nt9.74□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 STR3YGL184C 1398 nt9.74□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 VPS75YNL246W 795 nt9.73□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 RTN2YDL204W 1182 nt9.72□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 DAT1YML113W 747 nt9.72□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 NPP1YCR026C 2229 nt9.72□□□□□ -0.85
ATG38Q05789 YCR102CYCR102C 1107 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 ALG12YNR030W 1656 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 IRC24YIR036C 792 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 PAU7YAR020C 168 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 YAT1YAR035W 2064 nt9.7□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 DUT1YBR252W 444 nt9.67□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 SFP1YLR403W 2052 nt9.67□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.66□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.66□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 YFR018CYFR018C 1092 nt9.66□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 SGT2YOR007C 1041 nt9.66□□□□□ -0.86
ATG38Q05789 NIT1YIL164C 600 nt9.64□□□□□ -0.87
ATG38Q05789 ILV2YMR108W 2064 nt9.63□□□□□ -0.87
ATG38Q05789 RRT5YFR032C 870 nt9.63□□□□□ -0.87
ATG38Q05789 HEL2YDR266C 1920 nt9.6□□□□□ -0.87
ATG38Q05789 DTR1YBR180W 1719 nt9.6□□□□□ -0.87
ATG38Q05789 HSL7YBR133C 2484 nt9.6□□□□□ -0.87
ATG38Q05789 YFL066CYFL066C 1179 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG38Q05789 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.58□□□□□ -0.88
ATG38Q05789 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.58□□□□□ -0.88
ATG38Q05789 YDR094WYDR094W 336 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG38Q05789 NBP35YGL091C 987 nt9.54□□□□□ -0.88
ATG38Q05789 SNF1YDR477W 1902 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG38Q05789 LSC2YGR244C 1284 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG38Q05789 TIR3YIL011W 810 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG38Q05789 ARP6YLR085C 1317 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG38Q05789 SAM35YHR083W 990 nt9.49□□□□□ -0.89
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