Protein–RNA interactions for Protein: Q05027

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF9Q05027 TRM5YHR070W 1500 nt11.47□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 WSC2YNL283C 1512 nt11.47□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.47□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 YDR094WYDR094W 336 nt11.46□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 ERF2YLR246W 1080 nt11.46□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 TAD3YLR316C 969 nt11.46□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 ATF2YGR177C 1608 nt11.43□□□□□ -0.58
TAF9Q05027 HSP60YLR259C 1719 nt11.43□□□□□ -0.58
TAF9Q05027 YFL067WYFL067W 528 nt11.42□□□□□ -0.58
TAF9Q05027 DDR2YOL052C-A 186 nt11.42□□□□□ -0.58
TAF9Q05027 CRR1YLR213C 1269 nt11.39□□□□□ -0.59
TAF9Q05027 STB1YNL309W 1263 nt11.39□□□□□ -0.59
TAF9Q05027 UME6YDR207C 2511 nt11.38□□□□□ -0.59
TAF9Q05027 SPC25YER018C 666 nt11.37□□□□□ -0.59
TAF9Q05027 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.35□□□□□ -0.59
TAF9Q05027 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.34□□□□□ -0.59
TAF9Q05027 MIC10YCL057C-A 294 nt11.34□□□□□ -0.59
TAF9Q05027 CCT4YDL143W 1587 nt11.33□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 GPI16YHR188C 1833 nt11.32□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 HEM12YDR047W 1089 nt11.31□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.31□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 YFR018CYFR018C 1092 nt11.3□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 SNG1YGR197C 1644 nt11.3□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 ANP1YEL036C 1503 nt11.28□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 GLK1YCL040W 1503 nt11.28□□□□□ -0.6
TAF9Q05027 FEN2YCR028C 1539 nt11.27□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 VPS60YDR486C 690 nt11.27□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 BDH1YAL060W 1149 nt11.27□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 FUR4YBR021W 1902 nt11.27□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 CCA1YER168C 1641 nt11.25□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 SWC5YBR231C 912 nt11.25□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 YLR415CYLR415C 339 nt11.24□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 YSP3YOR003W 1437 nt11.21□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 RRT5YFR032C 870 nt11.21□□□□□ -0.61
TAF9Q05027 ALG3YBL082C 1377 nt11.2□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 YFL066CYFL066C 1179 nt11.2□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 PRE6YOL038W 765 nt11.2□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 ALG12YNR030W 1656 nt11.19□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 PEX25YPL112C 1185 nt11.18□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 RAX1YOR301W 1308 nt11.17□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 YIR016WYIR016W 798 nt11.17□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 PAU16YKL224C 372 nt11.16□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 MCH5YOR306C 1566 nt11.16□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 YNL115CYNL115C 1935 nt11.15□□□□□ -0.62
TAF9Q05027 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.14□□□□□ -0.63
TAF9Q05027 BNA2YJR078W 1362 nt11.11□□□□□ -0.63
TAF9Q05027 PRP4YPR178W 1398 nt11.07□□□□□ -0.64
TAF9Q05027 AGP1YCL025C 1902 nt11.04□□□□□ -0.64
TAF9Q05027 DPS1YLL018C 1674 nt11.04□□□□□ -0.64
TAF9Q05027 MIC12YBR262C 321 nt11.03□□□□□ -0.64
TAF9Q05027 VPS75YNL246W 795 nt11.01□□□□□ -0.65
TAF9Q05027 TIM17YJL143W 477 nt10.99□□□□□ -0.65
TAF9Q05027 AAC1YMR056C 930 nt10.97□□□□□ -0.65
TAF9Q05027 HHO1YPL127C 777 nt10.97□□□□□ -0.65
TAF9Q05027 XDJ1YLR090W 1380 nt10.97□□□□□ -0.65
TAF9Q05027 SHM2YLR058C 1410 nt10.96□□□□□ -0.65
TAF9Q05027 SNF1YDR477W 1902 nt10.96□□□□□ -0.66
TAF9Q05027 YKR005CYKR005C 1578 nt10.94□□□□□ -0.66
TAF9Q05027 BIO5YNR056C 1686 nt10.93□□□□□ -0.66
TAF9Q05027 GDH3YAL062W 1374 nt10.92□□□□□ -0.66
TAF9Q05027 NAT4YMR069W 858 nt10.92□□□□□ -0.66
TAF9Q05027 YGR201CYGR201C 678 nt10.91□□□□□ -0.66
TAF9Q05027 NAR1YNL240C 1476 nt10.91□□□□□ -0.66
TAF9Q05027 MIR1YJR077C 936 nt10.89□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 PAU7YAR020C 168 nt10.89□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 DUS1YML080W 1272 nt10.88□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 YCL074WYCL074W 927 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 THI74YDR438W 1113 nt10.86□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 NIT1YIL164C 600 nt10.84□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 BMT6YLR063W 1098 nt10.84□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 MSF1YPR047W 1410 nt10.84□□□□□ -0.67
TAF9Q05027 SGT2YOR007C 1041 nt10.83□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 DUT1YBR252W 444 nt10.83□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 AVT6YER119C 1347 nt10.83□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 YGR259CYGR259C 441 nt10.82□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 PBP1YGR178C 2169 nt10.82□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.81□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.81□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 YJL225CYJL225C 5277 nt10.81□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 GOR1YNL274C 1053 nt10.8□□□□□ -0.68
TAF9Q05027 SHB17YKR043C 816 nt10.76□□□□□ -0.69
TAF9Q05027 DAT1YML113W 747 nt10.76□□□□□ -0.69
TAF9Q05027 UBA4YHR111W 1323 nt10.74□□□□□ -0.69
TAF9Q05027 STR3YGL184C 1398 nt10.74□□□□□ -0.69
TAF9Q05027 SBA1YKL117W 651 nt10.73□□□□□ -0.69
TAF9Q05027 IRC24YIR036C 792 nt10.72□□□□□ -0.69
TAF9Q05027 YDR010CYDR010C 333 nt10.71□□□□□ -0.69
TAF9Q05027 CYT2YKL087C 675 nt10.7□□□□□ -0.7
TAF9Q05027 YCR102CYCR102C 1107 nt10.68□□□□□ -0.7
TAF9Q05027 YSR3YKR053C 1215 nt10.68□□□□□ -0.7
TAF9Q05027 YGL034CYGL034C 366 nt10.67□□□□□ -0.7
TAF9Q05027 RET2YFR051C 1641 nt10.64□□□□□ -0.71
TAF9Q05027 AQY2YLL052C 450 nt10.63□□□□□ -0.71
TAF9Q05027 PHO89YBR296C 1725 nt10.62□□□□□ -0.71
TAF9Q05027 XYL2YLR070C 1071 nt10.61□□□□□ -0.71
TAF9Q05027 YAT1YAR035W 2064 nt10.57□□□□□ -0.72
TAF9Q05027 YCR087WYCR087W 516 nt10.57□□□□□ -0.72
TAF9Q05027 NBP35YGL091C 987 nt10.56□□□□□ -0.72
TAF9Q05027 RBG1YAL036C 1110 nt10.53□□□□□ -0.72
TAF9Q05027 SFA1YDL168W 1161 nt10.52□□□□□ -0.73
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