Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarcad1Q04692 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarcad1Q04692 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarcad1Q04692 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarcad1Q04692 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarcad1Q04692 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarcad1Q04692 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcad1Q04692 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarcad1Q04692 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarcad1Q04692 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcad1Q04692 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcad1Q04692 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Smarcad1Q04692 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcad1Q04692 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcad1Q04692 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcad1Q04692 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcad1Q04692 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcad1Q04692 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcad1Q04692 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcad1Q04692 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarcad1Q04692 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarcad1Q04692 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcad1Q04692 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcad1Q04692 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcad1Q04692 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcad1Q04692 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcad1Q04692 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarcad1Q04692 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcad1Q04692 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcad1Q04692 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcad1Q04692 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcad1Q04692 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcad1Q04692 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarcad1Q04692 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarcad1Q04692 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarcad1Q04692 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarcad1Q04692 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcad1Q04692 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcad1Q04692 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcad1Q04692 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarcad1Q04692 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarcad1Q04692 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarcad1Q04692 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcad1Q04692 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarcad1Q04692 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarcad1Q04692 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarcad1Q04692 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarcad1Q04692 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarcad1Q04692 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms