Protein–RNA interactions for Protein: Q04336

YMR196W, Uncharacterized protein YMR196W, yeastyeast

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WQ04336 RPM1RPM1 483 nt14.89□□□□□ -0.03
YMR196WQ04336 YMR090WYMR090W 684 nt14.85□□□□□ -0.03
YMR196WQ04336 FTR1YER145C 1215 nt14.84□□□□□ -0.03
YMR196WQ04336 CCT4YDL143W 1587 nt14.82□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 RBG1YAL036C 1110 nt14.82□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 SAM1YLR180W 1149 nt14.82□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 GAL1YBR020W 1587 nt14.81□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 STB1YNL309W 1263 nt14.8□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 UBA4YHR111W 1323 nt14.79□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 SWC5YBR231C 912 nt14.79□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 YMR226CYMR226C 804 nt14.78□□□□□ -0.04
YMR196WQ04336 YSR3YKR053C 1215 nt14.77□□□□□ -0.05
YMR196WQ04336 TRM5YHR070W 1500 nt14.75□□□□□ -0.05
YMR196WQ04336 SPC25YER018C 666 nt14.74□□□□□ -0.05
YMR196WQ04336 YGR139WYGR139W 339 nt14.73□□□□□ -0.05
YMR196WQ04336 GPI16YHR188C 1833 nt14.71□□□□□ -0.05
YMR196WQ04336 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.71□□□□□ -0.05
YMR196WQ04336 XYL2YLR070C 1071 nt14.71□□□□□ -0.05
YMR196WQ04336 SPT5YML010W 3192 nt14.69□□□□□ -0.06
YMR196WQ04336 BIO4YNR057C 714 nt14.67□□□□□ -0.06
YMR196WQ04336 SPT8YLR055C 1809 nt14.66□□□□□ -0.06
YMR196WQ04336 VPS60YDR486C 690 nt14.66□□□□□ -0.06
YMR196WQ04336 RAD51YER095W 1203 nt14.66□□□□□ -0.06
YMR196WQ04336 DDR2YOL052C-A 186 nt14.65□□□□□ -0.06
YMR196WQ04336 SHB17YKR043C 816 nt14.64□□□□□ -0.07
YMR196WQ04336 SCC4YER147C 1875 nt14.63□□□□□ -0.07
YMR196WQ04336 YNL195CYNL195C 786 nt14.63□□□□□ -0.07
YMR196WQ04336 SIM1YIL123W 1431 nt14.61□□□□□ -0.07
YMR196WQ04336 ALG3YBL082C 1377 nt14.57□□□□□ -0.08
YMR196WQ04336 TIM17YJL143W 477 nt14.53□□□□□ -0.08
YMR196WQ04336 YCR087WYCR087W 516 nt14.52□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 YNR029CYNR029C 1290 nt14.52□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 SDH1YKL148C 1923 nt14.52□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 YFL067WYFL067W 528 nt14.51□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 FEN2YCR028C 1539 nt14.5□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 YLR111WYLR111W 333 nt14.49□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt14.48□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 ATF2YGR177C 1608 nt14.48□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 AIM45YPR004C 1035 nt14.47□□□□□ -0.09
YMR196WQ04336 PHO89YBR296C 1725 nt14.46□□□□□ -0.1
YMR196WQ04336 STE4YOR212W 1272 nt14.43□□□□□ -0.1
YMR196WQ04336 YDR010CYDR010C 333 nt14.42□□□□□ -0.1
YMR196WQ04336 NME1NME1 340 nt14.41□□□□□ -0.1
YMR196WQ04336 ERF2YLR246W 1080 nt14.38□□□□□ -0.11
YMR196WQ04336 RET2YFR051C 1641 nt14.36□□□□□ -0.11
YMR196WQ04336 RRT12YCR045C 1476 nt14.34□□□□□ -0.11
YMR196WQ04336 MRP20YDR405W 792 nt14.34□□□□□ -0.11
YMR196WQ04336 YIR016WYIR016W 798 nt14.34□□□□□ -0.11
YMR196WQ04336 ANP1YEL036C 1503 nt14.34□□□□□ -0.11
YMR196WQ04336 ADH7YCR105W 1086 nt14.33□□□□□ -0.12
YMR196WQ04336 PAU15YIR041W 375 nt14.33□□□□□ -0.12
YMR196WQ04336 SHM2YLR058C 1410 nt14.31□□□□□ -0.12
YMR196WQ04336 YLR349WYLR349W 507 nt14.3□□□□□ -0.12
YMR196WQ04336 YBR220CYBR220C 1683 nt14.26□□□□□ -0.13
YMR196WQ04336 SGT2YOR007C 1041 nt14.26□□□□□ -0.13
YMR196WQ04336 CRR1YLR213C 1269 nt14.23□□□□□ -0.13
YMR196WQ04336 SDH5YOL071W 489 nt14.21□□□□□ -0.13
YMR196WQ04336 SNG1YGR197C 1644 nt14.18□□□□□ -0.14
YMR196WQ04336 COQ2YNR041C 1119 nt14.17□□□□□ -0.14
YMR196WQ04336 XDJ1YLR090W 1380 nt14.17□□□□□ -0.14
YMR196WQ04336 HEM12YDR047W 1089 nt14.16□□□□□ -0.14
YMR196WQ04336 FUN14YAL008W 597 nt14.16□□□□□ -0.14
YMR196WQ04336 NIT1YIL164C 600 nt14.14□□□□□ -0.15
YMR196WQ04336 YLR279WYLR279W 390 nt14.13□□□□□ -0.15
YMR196WQ04336 RAD23YEL037C 1197 nt14.09□□□□□ -0.15
YMR196WQ04336 YJL195CYJL195C 702 nt14.08□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 MIC10YCL057C-A 294 nt14.08□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 GDH3YAL062W 1374 nt14.08□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 RPL4BYDR012W 1089 nt14.04□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt14.04□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 GPN2YOR262W 1044 nt14.04□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 RPL4AYBR031W 1089 nt14.04□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 YHL050CYHL050C 2094 nt14.03□□□□□ -0.16
YMR196WQ04336 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt14.01□□□□□ -0.17
YMR196WQ04336 CLB6YGR109C 1143 nt13.99□□□□□ -0.17
YMR196WQ04336 BNA2YJR078W 1362 nt13.96□□□□□ -0.17
YMR196WQ04336 ESS1YJR017C 513 nt13.96□□□□□ -0.17
YMR196WQ04336 SFA1YDL168W 1161 nt13.92□□□□□ -0.18
YMR196WQ04336 RIB3YDR487C 627 nt13.91□□□□□ -0.18
YMR196WQ04336 CPD1YGR247W 720 nt13.9□□□□□ -0.18
YMR196WQ04336 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt13.9□□□□□ -0.18
YMR196WQ04336 RPS14BYJL191W 417 nt13.9□□□□□ -0.18
YMR196WQ04336 CAB5YDR196C 726 nt13.87□□□□□ -0.19
YMR196WQ04336 YGR012WYGR012W 1182 nt13.85□□□□□ -0.19
YMR196WQ04336 NAP1YKR048C 1254 nt13.85□□□□□ -0.19
YMR196WQ04336 ADH1YOL086C 1047 nt13.84□□□□□ -0.19
YMR196WQ04336 TSC10YBR265W 963 nt13.84□□□□□ -0.19
YMR196WQ04336 YEL008WYEL008W 381 nt13.82□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 UTH1YKR042W 1098 nt13.81□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 SEN2YLR105C 1134 nt13.81□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 HHO1YPL127C 777 nt13.8□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 AVT6YER119C 1347 nt13.8□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 LYS4YDR234W 2082 nt13.79□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 PUP1YOR157C 786 nt13.79□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 MIC12YBR262C 321 nt13.79□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 SSA4YER103W 1929 nt13.78□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 YGR201CYGR201C 678 nt13.78□□□□□ -0.2
YMR196WQ04336 YCR102CYCR102C 1107 nt13.77□□□□□ -0.21
YMR196WQ04336 GOR1YNL274C 1053 nt13.72□□□□□ -0.21
YMR196WQ04336 YPI1YFR003C 468 nt13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms