Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Aplp1Q03157 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Aplp1Q03157 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Aplp1Q03157 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Aplp1Q03157 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Aplp1Q03157 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Aplp1Q03157 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Aplp1Q03157 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Aplp1Q03157 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Aplp1Q03157 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Aplp1Q03157 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Aplp1Q03157 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Aplp1Q03157 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Aplp1Q03157 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Aplp1Q03157 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Aplp1Q03157 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Aplp1Q03157 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Aplp1Q03157 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Aplp1Q03157 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Aplp1Q03157 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Aplp1Q03157 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Aplp1Q03157 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Aplp1Q03157 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Aplp1Q03157 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Aplp1Q03157 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Aplp1Q03157 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Aplp1Q03157 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Aplp1Q03157 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Aplp1Q03157 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Aplp1Q03157 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Aplp1Q03157 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Aplp1Q03157 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Aplp1Q03157 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Aplp1Q03157 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Aplp1Q03157 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Aplp1Q03157 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Aplp1Q03157 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Aplp1Q03157 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Aplp1Q03157 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Aplp1Q03157 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Aplp1Q03157 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Aplp1Q03157 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Aplp1Q03157 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Aplp1Q03157 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Aplp1Q03157 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Aplp1Q03157 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Aplp1Q03157 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Aplp1Q03157 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Aplp1Q03157 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Aplp1Q03157 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Aplp1Q03157 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Aplp1Q03157 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Aplp1Q03157 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Aplp1Q03157 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Aplp1Q03157 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Aplp1Q03157 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Aplp1Q03157 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Aplp1Q03157 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Aplp1Q03157 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Aplp1Q03157 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Aplp1Q03157 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Aplp1Q03157 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Aplp1Q03157 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Aplp1Q03157 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Aplp1Q03157 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Aplp1Q03157 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Aplp1Q03157 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms