Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 MIC10YCL057C-A 294 nt10.05□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.04□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 YKL030WYKL030W 606 nt10.04□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 YLR179CYLR179C 606 nt10.04□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 SWE1YJL187C 2460 nt10.04□□□□□ -0.8
YKR011CQ02209 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.02□□□□□ -0.81
YKR011CQ02209 ANP1YEL036C 1503 nt9.98□□□□□ -0.81
YKR011CQ02209 SPC25YER018C 666 nt9.97□□□□□ -0.81
YKR011CQ02209 STB1YNL309W 1263 nt9.97□□□□□ -0.81
YKR011CQ02209 RTG1YOL067C 534 nt9.97□□□□□ -0.81
YKR011CQ02209 RAX1YOR301W 1308 nt9.97□□□□□ -0.81
YKR011CQ02209 UME6YDR207C 2511 nt9.96□□□□□ -0.81
YKR011CQ02209 AHT1YHR093W 549 nt9.96□□□□□ -0.82
YKR011CQ02209 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.95□□□□□ -0.82
YKR011CQ02209 WSC2YNL283C 1512 nt9.95□□□□□ -0.82
YKR011CQ02209 YPR064WYPR064W 420 nt9.93□□□□□ -0.82
YKR011CQ02209 GPI16YHR188C 1833 nt9.93□□□□□ -0.82
YKR011CQ02209 BOR1YNL275W 1731 nt9.93□□□□□ -0.82
YKR011CQ02209 FEN2YCR028C 1539 nt9.91□□□□□ -0.82
YKR011CQ02209 BNA2YJR078W 1362 nt9.88□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 CCT4YDL143W 1587 nt9.88□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 VPS60YDR486C 690 nt9.86□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.86□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 YEL076CYEL076C 651 nt9.86□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 TAD3YLR316C 969 nt9.86□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 YLR464WYLR464W 651 nt9.86□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 CCA1YER168C 1641 nt9.85□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 MIC12YBR262C 321 nt9.85□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 MRPL8YJL063C 717 nt9.84□□□□□ -0.83
YKR011CQ02209 HUA1YGR268C 597 nt9.82□□□□□ -0.84
YKR011CQ02209 YIR016WYIR016W 798 nt9.82□□□□□ -0.84
YKR011CQ02209 SWC5YBR231C 912 nt9.82□□□□□ -0.84
YKR011CQ02209 ALG3YBL082C 1377 nt9.8□□□□□ -0.84
YKR011CQ02209 ADO1YJR105W 1023 nt9.78□□□□□ -0.84
YKR011CQ02209 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.77□□□□□ -0.85
YKR011CQ02209 HHO1YPL127C 777 nt9.74□□□□□ -0.85
YKR011CQ02209 HSP60YLR259C 1719 nt9.73□□□□□ -0.85
YKR011CQ02209 FUR4YBR021W 1902 nt9.72□□□□□ -0.85
YKR011CQ02209 YGR201CYGR201C 678 nt9.72□□□□□ -0.85
YKR011CQ02209 BDH1YAL060W 1149 nt9.72□□□□□ -0.85
YKR011CQ02209 AGP1YCL025C 1902 nt9.71□□□□□ -0.86
YKR011CQ02209 YLR415CYLR415C 339 nt9.7□□□□□ -0.86
YKR011CQ02209 GLK1YCL040W 1503 nt9.69□□□□□ -0.86
YKR011CQ02209 MCH5YOR306C 1566 nt9.67□□□□□ -0.86
YKR011CQ02209 XDJ1YLR090W 1380 nt9.64□□□□□ -0.87
YKR011CQ02209 YSP3YOR003W 1437 nt9.64□□□□□ -0.87
YKR011CQ02209 DUS1YML080W 1272 nt9.63□□□□□ -0.87
YKR011CQ02209 YCL074WYCL074W 927 nt9.61□□□□□ -0.87
YKR011CQ02209 ALG12YNR030W 1656 nt9.61□□□□□ -0.87
YKR011CQ02209 GDH3YAL062W 1374 nt9.59□□□□□ -0.87
YKR011CQ02209 TIM17YJL143W 477 nt9.57□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 AVT6YER119C 1347 nt9.56□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 SHM2YLR058C 1410 nt9.56□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 PRP4YPR178W 1398 nt9.56□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 GOR1YNL274C 1053 nt9.56□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 PEX25YPL112C 1185 nt9.54□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 DUT1YBR252W 444 nt9.54□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 YNL115CYNL115C 1935 nt9.54□□□□□ -0.88
YKR011CQ02209 YKR005CYKR005C 1578 nt9.51□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 STR3YGL184C 1398 nt9.5□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.5□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.5□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 DPS1YLL018C 1674 nt9.5□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 YFR018CYFR018C 1092 nt9.49□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 BMT6YLR063W 1098 nt9.48□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 CSM2YIL132C 642 nt9.47□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 NIT1YIL164C 600 nt9.47□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 MET8YBR213W 825 nt9.47□□□□□ -0.89
YKR011CQ02209 YFL066CYFL066C 1179 nt9.46□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 DAT1YML113W 747 nt9.46□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 VPS75YNL246W 795 nt9.46□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 YGR259CYGR259C 441 nt9.45□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 AAC1YMR056C 930 nt9.45□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 AQY2YLL052C 450 nt9.44□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 SGT2YOR007C 1041 nt9.43□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 YDR094WYDR094W 336 nt9.42□□□□□ -0.9
YKR011CQ02209 YCR102CYCR102C 1107 nt9.39□□□□□ -0.91
YKR011CQ02209 CLB6YGR109C 1143 nt9.38□□□□□ -0.91
YKR011CQ02209 RTN2YDL204W 1182 nt9.37□□□□□ -0.91
YKR011CQ02209 PRE6YOL038W 765 nt9.37□□□□□ -0.91
YKR011CQ02209 IRC24YIR036C 792 nt9.36□□□□□ -0.91
YKR011CQ02209 NBP35YGL091C 987 nt9.34□□□□□ -0.91
YKR011CQ02209 SNF1YDR477W 1902 nt9.34□□□□□ -0.91
YKR011CQ02209 RRT5YFR032C 870 nt9.33□□□□□ -0.92
YKR011CQ02209 NAR1YNL240C 1476 nt9.32□□□□□ -0.92
YKR011CQ02209 PAU7YAR020C 168 nt9.3□□□□□ -0.92
YKR011CQ02209 ARP6YLR085C 1317 nt9.27□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 BIO5YNR056C 1686 nt9.26□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 UBX6YJL048C 1191 nt9.25□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 PAU16YKL224C 372 nt9.25□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 TIR3YIL011W 810 nt9.23□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 MIR1YJR077C 936 nt9.23□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 PLB1YMR008C 1995 nt9.23□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 PBP1YGR178C 2169 nt9.22□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 SHB17YKR043C 816 nt9.22□□□□□ -0.93
YKR011CQ02209 YDR010CYDR010C 333 nt9.21□□□□□ -0.94
YKR011CQ02209 LSC2YGR244C 1284 nt9.2□□□□□ -0.94
YKR011CQ02209 FRE6YLL051C 2139 nt9.17□□□□□ -0.94
YKR011CQ02209 SHH4YLR164W 507 nt9.16□□□□□ -0.94
YKR011CQ02209 RET2YFR051C 1641 nt9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms