Protein–RNA interactions for Protein: Q01766

HAL1, Halotolerance protein HAL1, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL1Q01766 YLL053CYLL053C 459 nt8.06□□□□□ -1.12
HAL1Q01766 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.04□□□□□ -1.12
HAL1Q01766 RPM1RPM1 483 nt8.04□□□□□ -1.12
HAL1Q01766 FTR1YER145C 1215 nt8.03□□□□□ -1.12
HAL1Q01766 AHT1YHR093W 549 nt8.03□□□□□ -1.12
HAL1Q01766 ERF2YLR246W 1080 nt8.02□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 TAD3YLR316C 969 nt8.01□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 UBX6YJL048C 1191 nt8□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 WSC2YNL283C 1512 nt7.99□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 ALG12YNR030W 1656 nt7.99□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 YFL067WYFL067W 528 nt7.99□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 GAL1YBR020W 1587 nt7.99□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 LYS4YDR234W 2082 nt7.98□□□□□ -1.13
HAL1Q01766 TRM5YHR070W 1500 nt7.95□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 SPC25YER018C 666 nt7.95□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 CRR1YLR213C 1269 nt7.95□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 DDR2YOL052C-A 186 nt7.94□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 YFR018CYFR018C 1092 nt7.93□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 STB1YNL309W 1263 nt7.93□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 SWE1YJL187C 2460 nt7.93□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 GPI16YHR188C 1833 nt7.92□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 ATF2YGR177C 1608 nt7.92□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt7.91□□□□□ -1.14
HAL1Q01766 CCT4YDL143W 1587 nt7.89□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt7.89□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 HEM12YDR047W 1089 nt7.87□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 ANP1YEL036C 1503 nt7.87□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 RRT5YFR032C 870 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 BDH1YAL060W 1149 nt7.85□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 YLR415CYLR415C 339 nt7.85□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 SNG1YGR197C 1644 nt7.85□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 FEN2YCR028C 1539 nt7.84□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 SWC5YBR231C 912 nt7.84□□□□□ -1.15
HAL1Q01766 VPS60YDR486C 690 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL1Q01766 PEX25YPL112C 1185 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL1Q01766 HSP60YLR259C 1719 nt7.82□□□□□ -1.16
HAL1Q01766 YSP3YOR003W 1437 nt7.82□□□□□ -1.16
HAL1Q01766 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.79□□□□□ -1.16
HAL1Q01766 PAU16YKL224C 372 nt7.78□□□□□ -1.16
HAL1Q01766 MIC10YCL057C-A 294 nt7.78□□□□□ -1.16
HAL1Q01766 ALG3YBL082C 1377 nt7.76□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt7.76□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 YIR016WYIR016W 798 nt7.76□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 YNL115CYNL115C 1935 nt7.76□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 PRE6YOL038W 765 nt7.74□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 BNA2YJR078W 1362 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 YFL066CYFL066C 1179 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 VPS75YNL246W 795 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 RAX1YOR301W 1308 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 NAR1YNL240C 1476 nt7.72□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 GLK1YCL040W 1503 nt7.72□□□□□ -1.17
HAL1Q01766 MIC12YBR262C 321 nt7.71□□□□□ -1.18
HAL1Q01766 TIM17YJL143W 477 nt7.69□□□□□ -1.18
HAL1Q01766 FUR4YBR021W 1902 nt7.69□□□□□ -1.18
HAL1Q01766 YGR201CYGR201C 678 nt7.66□□□□□ -1.18
HAL1Q01766 CCA1YER168C 1641 nt7.66□□□□□ -1.18
HAL1Q01766 NAT4YMR069W 858 nt7.65□□□□□ -1.18
HAL1Q01766 CMP2YML057W 1815 nt7.64□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 XDJ1YLR090W 1380 nt7.63□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 HHO1YPL127C 777 nt7.62□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 SHM2YLR058C 1410 nt7.61□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 HSL7YBR133C 2484 nt7.61□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 MIR1YJR077C 936 nt7.6□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 PAU7YAR020C 168 nt7.6□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 THI74YDR438W 1113 nt7.59□□□□□ -1.19
HAL1Q01766 GDH3YAL062W 1374 nt7.59□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 MSF1YPR047W 1410 nt7.58□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 PRP4YPR178W 1398 nt7.58□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 HEL2YDR266C 1920 nt7.56□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 DPS1YLL018C 1674 nt7.54□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 NIT1YIL164C 600 nt7.54□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 DAT1YML113W 747 nt7.53□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 AAC1YMR056C 930 nt7.53□□□□□ -1.2
HAL1Q01766 SGT2YOR007C 1041 nt7.52□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 AVT6YER119C 1347 nt7.52□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 GOR1YNL274C 1053 nt7.51□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 AGP1YCL025C 1902 nt7.5□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 MET2YNL277W 1461 nt7.5□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 UBA4YHR111W 1323 nt7.5□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 SHB17YKR043C 816 nt7.49□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 YKR005CYKR005C 1578 nt7.49□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 RDN25-1RDN25-1 3396 nt7.48□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 RDN25-2RDN25-2 3396 nt7.48□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 SNF1YDR477W 1902 nt7.46□□□□□ -1.21
HAL1Q01766 YCR087WYCR087W 516 nt7.46□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 YCR102CYCR102C 1107 nt7.46□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 RET2YFR051C 1641 nt7.45□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 BIO5YNR056C 1686 nt7.45□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 YDR010CYDR010C 333 nt7.45□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 YGL034CYGL034C 366 nt7.45□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 SBA1YKL117W 651 nt7.45□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 YSR3YKR053C 1215 nt7.45□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 YAT1YAR035W 2064 nt7.44□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 YCL074WYCL074W 927 nt7.44□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 BMT6YLR063W 1098 nt7.44□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 CYT2YKL087C 675 nt7.43□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 PBP1YGR178C 2169 nt7.43□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 YGR259CYGR259C 441 nt7.4□□□□□ -1.22
HAL1Q01766 PHO89YBR296C 1725 nt7.39□□□□□ -1.23
HAL1Q01766 IRC24YIR036C 792 nt7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 110.3 ms