Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thumpd3P97770 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thumpd3P97770 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thumpd3P97770 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Thumpd3P97770 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Thumpd3P97770 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Thumpd3P97770 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thumpd3P97770 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Thumpd3P97770 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Thumpd3P97770 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thumpd3P97770 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Thumpd3P97770 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Thumpd3P97770 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Thumpd3P97770 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thumpd3P97770 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Thumpd3P97770 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Thumpd3P97770 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Thumpd3P97770 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Thumpd3P97770 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Thumpd3P97770 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Thumpd3P97770 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Thumpd3P97770 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Thumpd3P97770 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Thumpd3P97770 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Thumpd3P97770 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Thumpd3P97770 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Thumpd3P97770 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Thumpd3P97770 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Thumpd3P97770 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Thumpd3P97770 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Thumpd3P97770 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Thumpd3P97770 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thumpd3P97770 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Thumpd3P97770 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thumpd3P97770 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thumpd3P97770 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thumpd3P97770 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thumpd3P97770 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Thumpd3P97770 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thumpd3P97770 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thumpd3P97770 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thumpd3P97770 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thumpd3P97770 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms