Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnab3P97382 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnab3P97382 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnab3P97382 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnab3P97382 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnab3P97382 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnab3P97382 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnab3P97382 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnab3P97382 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnab3P97382 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnab3P97382 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnab3P97382 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnab3P97382 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnab3P97382 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnab3P97382 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnab3P97382 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnab3P97382 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnab3P97382 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnab3P97382 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnab3P97382 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnab3P97382 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnab3P97382 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnab3P97382 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnab3P97382 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnab3P97382 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnab3P97382 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnab3P97382 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnab3P97382 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnab3P97382 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnab3P97382 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnab3P97382 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnab3P97382 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnab3P97382 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnab3P97382 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnab3P97382 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnab3P97382 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnab3P97382 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnab3P97382 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnab3P97382 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnab3P97382 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms